|
|
Genetics In the 3rd Millennium، جلد ۱۳، شماره ۱، صفحات ۳۹۵۴-۳۹۶۱
|
|
|
| عنوان فارسی |
پیش بینی اپی‌توپ های B و T cell آنتی‌ژن P۴۰ به منظور توسعه واکسن مایکوپلاسما آگالاکتیه با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی |
|
| چکیده فارسی مقاله |
آگالاکسی یک بیماری مسری در نشخوارکنندگان کوچک است که توسط باکتری مایکوپلاسما آگالاکتیه ایجاد می‌شود. پروتئین P40 از مهم‌ترین آنتی‌ژن‌های سطحی در باکتری مایکوپلاسما آگالاکتیه است، که می‌توان از آن به منظور طراحی واکسن نوترکیب استفاده کرد. هدف از مطالعه حاضر به دست آوردن ویژگی‌های بیوانفورماتیک آنتی‌ژن P40 بود. به همین منظور، طیف گسترده‌ای از نرم افزارهای آنلاین به منظور پیش بینی B و Tcell اپی‌توپ‌ها ، ساختار دوم ، سوم و آنتی‌ژنی‌سیته مورد استفاده قرار گرفت. روش‌های بیوانفورماتیکی مورد استفاده در مطالعه حاضر توسط مقایسه با نتایج چهار پیش بینی مختلف حاصل از کارهای آزمایشگاهی تایید شد. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی اسیدهای آمینه 24-40، 98-114، 218-240، 251-265 و 333-350 را برای B cell و اسیدهای آمینه 5-25، 86-105، 198-215 ، 143-153، 214-223 و 337-345 را برای T cell به عنوان اپی توپ نشان داد و مشخص شد تمامی B وcell T اپی‌توپ های پیش بینی شده بجز 5-25، 98-144، 141-157، 199-215 و 333-350 داری قدرت آنتی‌ژنی‌سیته می‌باشند . در نهایت، تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک نشان داد که این مناطق به طور کامل‌داری خصوصیات اپی‌توپی بوده و می‌توانند برای توسعه واکسن نوترکیب مفید باشند. |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
|
|
| عنوان انگلیسی |
B and T-cell epitopes prediction of the P40 antigen for developing Mycoplasma Agalactiae vaccine Using Bioinformatic Tools |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Agalactia is a disease affecting small ruminants which is caused by a mycoplasma agalactiae. P40 protein is the most important surface antigen in mycoplasma agalactiae bacteria that can be used to design recombinant vaccine. The objective of present study was obtain the bioinformatic characteristics of p40 antigen. A wide range of on-line prediction softwares were used to predict B and T-cells epitopes, secondary and tertiary structure and antigenicity. Applied bioinformatic approaches used in this study was validated by comparing results with four different experimental epitope predictions. Bioinformatic analysis, identified B-cell epitopes located at amino acid residues 24-40, 98-114, 218-240, 251-265 and 333-350, and T-cell epitopes at amino acids 5-25, 86-105, 198-215, 143-153, 214-223 and 337-345. All final predicted B and T-cell epitopes had antigenic ability except 5-25, 98-144, 141-157, 199-215 and 333-350 residuals. Finally, bioinformatic analysis showed that these regions had proper epitopes characteristics and may be useful for developing recombinant vaccines. .Running title: Bioinformatic tools and epitopes prediction. |
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
|
|
| نویسندگان مقاله |
علی فروهرمهر | ali forouharmehr
محمد رضا نصیری | mohammad reza nassiry
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://www.g3m.ir/browse.php?a_code=A-10-1-126&slc_lang=en&sid=en |
| فایل مقاله |
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
عمومی |
| نوع مقاله منتشر شده |
Research |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|