این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
زیست فناوری گیاهان زراعی، جلد ۱۴، شماره ۲، صفحات ۵۳-۶۶
عنوان فارسی شناسایی و تحلیل برخی ژن‌های درگیر در مسیر دفاعی ‌ETI‌ در بنه‌های زعفران آلوده به بیماری ‌پوسیدگی بنه (Fusarium oxysporum)
چکیده فارسی مقاله زعفران (Crocus sativus L.)، گیاهی چندساله از خانواده زنبقیان است که عمدتا در ایران کشت می-شود. علیرغم ارزش اقتصادی بالای زعفران در ایران و جهان به عنوان یک ادویه گران‌بها، عوامل بیماری‌زا متعددی تهدیدی برای گیاه زعفران بوده و باعث کاهش عملکرد و کیفیت آن می‌شود. ژن‌های مقاومت (R-genes)، پروتئین‌های Rرا کد می‌کنند که مقاومت گیاهان علیه بیمارگر‌ها را فعال می‌کنند. ژن‌های NBS-LRR، خانواده‌ای از ژن‌های R درون سلولی هستند که مقاومت به گیاهان را از طریق ایجاد ایمنی تحریک شونده ETI القا می‌کنند. در این مطالعه ترنسکریپتوم بنه زعفران آلوده به بیمارگرFusarium oxysporum به منظور شناسایی ژن‌های NBS-LRR در دو بازه زمانی 48 و 72 ساعت بعد از تلقیح با کمک نرم افزار‌های بیوانفورماتیک به صورت in silico آنالیز شدند. از توالی‌های ژنی NBS-LRR آرابیدوپسیس، برای شناسایی اعضای NBS-LRR در ترانسکریپتوم زعفران استفاده شد. سپس، پروفایل بیانی ژن‌های کاندید NBS-LRR مورد مطالعه قرار گرفت. بر اساس نتایج الگوریتم Blastx، تعداد 63326 رونوشت مستندسازی شدند. نتایج این مطالعه نشان داد که ترنسکریپتوم زعفران حاوی تعداد 30 رونوشت از ژن‌های NBS-LRR است. تجزیه و تحلیل بیان ژن‌های انتخابی NBS-LRR نشان داد که بیان آن‌ها در 72 ساعت پس از تلیقح در مقایسه با 48 ساعت پس از تلقیح بیشتر بود. ژن LRR1 در 48 و 72 ساعت پس از تلقیح سطح بیان بالاتری نسبت به ژن LRR2 داشت. علاوه بر این، نتایج این مطالعه نشان داد که ژن‌های NBS-LRR تقریباً در تمام بافت‌های زعفران بیان می‌شوند و همچنین در پاسخ زعفران علیه بیمارگر قارچی نقش دارند که می‌توان از آنها در برنامه‌های آینده بهنژادی زعفران استفاده کرد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله بیان ژن،بیوانفورماتیک،بیماری پوسیدگی بنه،ژن NBS-LRR،
عنوان انگلیسی Identification and expression analysis of genes involved in the ETI defense pathway in saffron corms infected with corm rot disease (Fusarium oxysporum)
چکیده انگلیسی مقاله Saffron (Crocus sativus L.), a perennial plant of the Iridaceae family, is predominantly cultivated in Iran. Despite its ‎high economic value both domestically and globally as a precious spice, its cultivation faces substantial challenges from ‎numerous pathogens which significantly impact both yield and quality. Resistance genes (R-genes) encode R-proteins that ‎play a crucial role in activating plant defense mechanisms against pathogens. Nucleotide-binding site leucine-rich repeat ‎‎(NBS-LRR) genes are a family of intracellular R-genes that confer resistance to plants by initiating Effector-Triggered ‎Immunity (ETI). In this study, an in silico study was conducted on the transcriptome of saffron corms infected with ‎Fusarium oxysporum to identify NBS-LRR genes at 48 and 72 hours after inoculation using bioinformatics software and ‎databases. Arabidopsis NBS-LRR gene sequences were used to identify NBS-LRR members in the saffron corm ‎transcriptome. Then, the expression profile of NBS-LRR candidate genes was studied. Based on the results of BLASTX ‎algorithms, 63326 transcripts were documented. The results of this study revealed the presence of 30 NBS-LRR gene ‎transcripts in the transcriptome of saffron corms. The expression of the selected genes was significantly up-regulated in ‎infected corms compared to healthy control corms. Furthermore, analysis of the selected NBS-LRR genes indicated that their ‎expression levels were higher at 72 hours after inoculation compared to 48 hours. The LRR1 gene had a higher expression ‎level than the LRR2 gene at 48 and 72-hours post-inoculation. Plus, the results of this study revealed that NBS-LRR genes ‎are expressed in almost all saffron tissues, suggesting their involvement in the saffron's response to fungal infections. The ‎findings of this study suggest that NBS-LRR genes hold significant potential for utilization in future saffron breeding ‎programs. ‎
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله بیان ژن,بیوانفورماتیک,بیماری پوسیدگی بنه,ژن NBS-LRR
نویسندگان مقاله نسرین همت پور |
دانش‌آموخته کارشناسی ارشد، گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‌آباد، ایران.

فرهاد نظریان فیروزآبادی |
استاد، گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‌آباد، ایران.

سید سجاد سهرابی |
استادیار، گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران

میترا خادمی |
استادیار، گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران

نشانی اینترنتی https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_11573_bec3784330fa9cae97d7ce4ca5a8a76b.pdf
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات