| چکیده انگلیسی مقاله |
Background: Protective antigen of anthrax toxin, after touching the cell receptors, plays an important role in the pathogenesis of toxin. The purpose of this study was to investigate the interaction of anthrax toxin protective antigen and four great combination propolis included caffeic acid, benzyl caffeate, cinnamic acid and kaempferol using the softwares and bioinformatics web servers. Methods: Three-dimensional structure of protective antigen (receptor) obtains from Protein Data Bank (PDB). Four of the main components from propolis were selected as ligand and their 3D-structures were obtained from ChemSpider and ZINC compound database. The interaction of each ligand and receptor was assessed by SwissDock server (http://www.swissdock.ch/) and BSP-SLIM server (http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/BSP-SLIM). Docking results appears with Fullfitness numbers (in kcal/mol). Identification of amino acids involved in ligand and receptor interaction, was performed using the Chimera software; UCSF Chimera program (http://www.cgl.ucsf.edu/). Results: The results of interaction between propolis components and protective antigen by BSP-SLIM server showed that the most interaction was related with benzyl caffeate, caffeic acid, kaempferol and cinnamic acid, respectively. Results for the desired ligand Interaction with protective antigen genes using SwissDock server showed that the caffeic acid had ΔG equals -9.10 kcal/mol and FullFitness equal to -993.16 kcal/mol respectively. The analysis of interaction between ligands with amino-acids of protective antigen indicated that the interaction of Caffeic acid whit Glutamic acid 117 had energy -15.5429 kcal/mol. Conclusion: Finding strong and safe inhibitors for anthrax toxin is very useful method for inhibiting its toxicity to cell. In this study the binding ability of four flavonoids to protective antigen was studied. Glutamic acid 117 is very effective in protective antigen binding and cell receptor and subsequent in virulent of anthrax toxin. Effective interaction of caffeic acid in propolis and glutamic acid 117 can be as useful in preventing the toxic effect on cell. According to our results, all four flavonoids tested in this study have binding activity to protective antigen and are good choices for fighting against anthrax. |
| نویسندگان مقاله |
المیرا محمدی | elmira mohammadi
department of pharmaceutical biotechnology, school of pharmacy, isfahan university of medical sciences, isfahan, iran.
گروه بیوتکنولوژی دارویی، دانشکده ی داروسازی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، ایران.
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی اصفهان (Isfahan university of medical sciences)
شاهین گوانجی | shahin gavanji
young researchers and elite club, isfahan khorasgan branch, islamic azad university, east jey st., university blvd., isfahan, iran. tel 98- 31- 35002549
اصفهان، باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد خوراسگان، خیابان جی شرقی، بلوار دانشگاه. تلفن 35002549 -031
سازمان اصلی تایید شده: باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان
فایزه خزیمه | faezeh khozimeh
dental research center, department of oral medicine, school of dentistry, isfahan university of medical sciences, isfahan, iran.
مرکز تحقیقات دندانپزشکی، گروه بیماری های دهان فک و صورت، دانشکده دندانپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران.
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی اصفهان (Isfahan university of medical sciences)
زهرا گلستان نژاد | zahra golestannejad
dental research center, department of oral medicine, school of dentistry, isfahan university of medical sciences, isfahan, iran.
مرکز تحقیقات دندانپزشکی، گروه بیماری های دهان فک و صورت، دانشکده دندانپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران.
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی اصفهان (Isfahan university of medical sciences)
محمدرضا گلستان نژاد | mohammadreza golestannejad
department of orthopedic, isa ben maryam hospital, school of medicine, isfahan university of medical sciences, isfahan, iran.
گروه ارتوپدی، بیمارستان عیسی ابن مریم، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران.
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی اصفهان (Isfahan university of medical sciences)
مهین بخشی | mahin bakhshi
department of oral and maxillofacial medicine, school of dentistry, shahid beheshti university of medical sciences, tehran, iran.
گروه بیماری های دهان فک و صورت، دانشکده دندانپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران.
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی (Shahid beheshti university of medical sciences)
هژیر یوسف شاهی | hazhir yousefshahi
dental student, students research center, school of dentistry, isfahan university of medical sciences, isfahan, iran.
دانشجوی دندانپزشکی، کمیته پژوهش های دانشجویان، دانشکده دندانپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران.
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی اصفهان (Isfahan university of medical sciences)
محسن دوست محمدی | mohsen doostmohammadi
young researchers and elite club, isfahan khorasgan branch, islamic azad university, isfahan, iran.
باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد خوراسگان، اصفهان، ایران.
سازمان اصلی تایید شده: باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان
|