این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
یکشنبه 20 مهر 1404
مجله دانشکده پزشکی اصفهان
، جلد ۲۹، شماره ۱۶۶، صفحات ۰-۰
عنوان فارسی
شناسایی مورفولوژیک و ژنوتیپیک برخی جدایههای آسپرژیلوس محیطی در ایران بر اساس توالی ژن بتا توبولین (β-tubulin)
چکیده فارسی مقاله
مقدمه: آسپرژیلوس ها جنس متنوعی از قارچ های رشته ای شامل گروه ها و گونه های متعدد هستند. شناسایی این قارچ ها از جنبه های مختلف مانند بیماری زایی، توکسین زایی و صنعتی حایز اهمیت است. روش های معمول آزمایشگاهی برای افتراق گونه های آسپرژیلوس شامل بررسی خصوصیات ظاهری و میکرو سکوپی کلنی می باشد. روش های فوق وقت گیر بوده و احتیاج به پرسنل مجرب دارد. هدف مطالعه ی حاضر، استفاده از تعیین توالی ژن بتا توبولین همراه با داده های مورفولوژیک برای شناسایی گونه های آسپرژیلوس جدا شده از برخی محیط ها در ایران بود. روش ها: در این مطالعه حدود 200 سویه ی آسپرژیلوس جدا شده از خاک و هوای محیط های مختلف، اعم از بیمارستان و اماکن طبیعی و عمومی مورد استفاده قرار گرفتند. تمام ایزوله ها روی محیط های چاپکس آگار و سابورو کشت مجدد شدند و پس از کشت روی لام مورد شناسایی اولیه قرار گرفتند. DNAی ژنومی تمام ایزوله ها به روش خرد کردن با گریندر استخراج گردید و به دنبال آن ژن بتا توبولین (β-tubulin) هر یک از نمونه ها از طریق واکنش زنجیره ای پلی مراز (Polymeraze chain reaction یا PCR) تقویت گردید و از بین آن ها 21 ایزوله به عنوان نمایندگان خصوصیات ماکروسکوپی و میکروسکوپی تعیین توالی گردیدند و داده های حاصل از طریق مقایسه با اطلاعات بانک ژن مورد بررسی و آنالیز قرار گرفت. یافته ها: از بین 21 ایزوله ی آسپرژیلوس که تعیین توالی شدند، 7 جدایه به عنوان آسپرژیلوس فلاووس (Aspergillus flavus)، 3 جدایه آسپرژیلوس فومیگاتوس (A. fumigates)، 3 جدایه آسپرژیلوس چوالیری (A. chevalieri)، 2 جدایه آسپرژیلوس توبینژنسیس (A. tubingensis)، 2 جدایه آسپرژیلوس نیوئوگلاکوس (A. niveoglacus)، 2 جدایه به عنوان آسپرژیلوس روبر (A. ruber)، یک جدایه آسپرژیلوس نایجر (A. niger) و یک جدایه نیز به عنوان آسپرژیلوس ورسیکالر (A. versicolor) شناسایی شدند. یافته های مورفولوژی با نتایج ژنوتیپی تأیید گردید. نتیجه گیری: یافته های این مطالعه نشان داد که تعیین توالی ژن بتا توبولین برای شناسایی جدایه های محیطی آسپرژیلوس در سطح گونه بسیار با ارزش است و این روش، اعتبار بیشتری در مقایسه با بررسی ریخت شناسی جدایه ها دارد. استفاده از دیگر اهداف ژنتیکی و روش های مولکولی مبتنی بر DNA برای مطالعه ی بیشتر گونه های آسپرژیلوس توصیه می شود.
کلیدواژههای فارسی مقاله
آسپرژیلوس، بتا توبولین، شناسایی.
عنوان انگلیسی
Morphological and Genotypic Identification of Some Environmental Isolates of Aspergillus in Iran Based on Beta-Tubulin Gene Sequencing
چکیده انگلیسی مقاله
Background: The genus Aspergillus is a mold consisting of various groups and species. Species identification of these fungi is important from pathogenic, toxigenic and industrial points of view. Conventional laboratory methods for delineation of Aspergillus species are based on macro- and microscopic characteristics of the colonies. These methods are time consuming and need expert technicians. The present study aimed to use beta tubulin (BT2) gene sequencing, in conjunction with morphological data, for species identification of Aspergillus strains isolated from some environments in Iran . Methods: Totally, about 200 Aspergillus strains, isolated from soils and air samples of different environments including hospitals, public and natural places, were used. All isolates were subcultured on Sabouraud dextrose agar and Czapec Dox agar. They were preliminarily identified based on micro slide-culture. Genomic DNA was extracted from all strains by a conical grinder and BT2 gene was amplified by polymerase chain reaction (PCR) from each sample. Among them, nucleotide sequences of 21 isolates, as representatives of morphologic features, were determined. The obtained data was analyzed via comparison with sequences existed in GenBank database. Findings: Among the 21 Aspergillus sequenced isolates, seven isolates were identified as Aspergillus flavus , 3 as Aspergillus fumigatus , 3 as Aspergillus chevalieri , 2 as Aspergillus tubingensis , 2 as Aspergillus niveoglacus , 2 as Aspergillus rubber , one as Aspergillus niger and one as Aspergillus versicolor . Morphological results were confirmed by genotypic data. Conclusion: The findings of this study indicated that sequencing beta tubulin gene is a valuable tool for species identification of Aspergillus environmental isolates. This method was found to be more valid in comparison with morphological analysis. Further studies with application of other genetic markers and molecular DNA-based procedures on discrimination of Aspergillus species are recommended.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
Aspergillus , Beta tubulin, Identification
نویسندگان مقاله
غلامرضا شکوهی | gholamreza shokoohi
دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی، دانشکدهی بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه علوم پزشکی تهران (Tehran university of medical sciences)
سید حسین میرهندی | seyed hossein mirhendi
دانشیار، گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی، دانشکدهی بهداشت و مؤسسهی ملی تحقیقات سلامت، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه علوم پزشکی تهران (Tehran university of medical sciences)
پریوش کردبچه | p kordbacheh
استاد، گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی، دانشکدهی بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه علوم پزشکی تهران (Tehran university of medical sciences)
مهناز نیک آیین | mahnaz nik aein
دانشیار، گروه مهندسی بهداشت محیط، دانشکدهی بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه علوم پزشکی اصفهان (Isfahan university of medical sciences)
علی رضایی مته کلایی | ali rezaei mateh kalayi
استادیار، گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی، دانشکدهی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز، اهواز، ایران
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز (Ahvaz jundishapur university of medical sciences)
مهدی عباس تبار | mehdi abbas tabar
دانشجوی دکتری، گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی، دانشکدهی بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه علوم پزشکی تهران (Tehran university of medical sciences)
نشانی اینترنتی
http://jims.mui.ac.ir/index.php/jims/article/view/1139
فایل مقاله
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/103/article-103-318680.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
مقاله پژوهشی
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات