این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
مجله دانشکده پزشکی اصفهان، جلد ۳۰، شماره ۲۱۹، صفحات ۲۳۳۳-۲۳۴۳
عنوان فارسی تشخیص باکتری‌های اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا با استفاده از آنالیز ژن ۲۳S rDNA
چکیده فارسی مقاله مقدمه: ژن های DNA ریبوزومی با داشتن ویژگی های منحصر به فرد همچون حضور در تمامی سلول های میکروارگانیسم ها، وجود مقادیر بالایی از این ژن ها در سلول و همچنین وجود نواحی محافظت شده یک کاندیدای مناسب جهت شناسایی طیف بالایی از میکروارگانیسم ها می باشند. هدف از این مطالعه، بررسی توالی محافظت شده و اختصاصی ژن 23S rDNA به عنوان یک هدف DNA در افتراق و غربالگری باکتری های اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا بود. روش ها: سویه های باکتریایی اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا از کلکسیون کشت میکروبی انستیتو پاستور ایران تهیه گردید. استخراج DNA از سویه های مورد نظر با استفاده از روش جوشاندن صورت گرفت. پس از بررسی منابع و اطلاعات موجود در بانک ژنی، ترادفی از نواحی محافظت شده ی ژن 23S rDNA و نواحی اختصاصی درون ژنی آن با توجه به هم ردیفی توالی ها، در نرم افزار AlignX از مجموعه ی نرم افزار Vector NTI انتخاب شد و PCR (Polymerase chain reaction) انجام گردید. یافته ها: نتایج حاصل از هم ردیفی قطعه ی اختصاصی ژن 23S rDNA در هر یک از باکتری های مورد بررسی بیانگر وجود قطعه ی ژنی به اندازه ی حدود 880 جفت باز در تمامی باکتری های مورد مطالعه بود. پروب های اختصاصی طراحی شده در هر یک از باکتری های اشریشیا کلی، سالمونلا انتریکا و شیگلا دیسانتری وجود باندهای 226، 444 و 776 جفت بازی را نشان داد. نتیجه گیری: نتایج به دست آمده در این مطالعه نشان داد که توالی 23S rDNA انتخاب شده در این پژوهش با توجه به محصولات به دست آمده ی حاصل از تکثیر آن، ناحیه ای مناسب و کارامد جهت افتراق و غربالگری سویه های باکتریایی اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا می باشد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله ژن 23S rDNA، باکتری های پاتوژن، Vector NTI
عنوان انگلیسی Detection of Escherichia Coli, Salmonella Enterica and Shigella Dysenteriae by Analysis of 23S Ribosomal DNA Gene
چکیده انگلیسی مقاله Background: Ribosomal DNA (rDNA) genes contain signature structures which are unique for groups of organisms. Considering their great number in cells and their protected areas, they render ideal targets for specific nucleic acid probes. The present study aimed to investigate the capability of some specific regions of 23S rDNA gene as a DNA target for differentiation and screening of Escherichia coli , Salmonella enterica , and Shigella dysenteriae . Methods: Bacterial reference strains used in this study were E. coli , S. enterica and Sh. dysenteriae that were provided by the centers for microbial culture collection (CMCC) at Pasture Institute of Iran. DNA extraction was performed by boiling method. Alignment of the 23S rDNA sequences of bacterial species was performed by using AlignX (a component of Vector NTI Advance 11.0) and areas displaying sequence divergence among species were used for designing universal primers and individual bacteria specific probe. Findings: The universal polymerase chain reaction (PCR) products of each bacterial species showed bands of approximately 880 bp to be being equivalent to the fragment size of 23S rDNA gene. Different size bands of 23S rDNA probes were produced and included 228 bp for E. coli , 444 bp for S. enterica , and 776 bp for Sh. dysenteriae . Conclusion: Comparative sequence analysis of variable and specific regions of 23S rDNA genes among the studied bacterial species showed that we were able to amplify specific target among universal region for the detection of many enteric pathogenic bacteria.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله 23S ribosomal DNA, Pathogenic bacteria, Vector NTI
نویسندگان مقاله میثم سرشار | meysam sarshar
کارشناس ارشد، مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه ا... عج ، تهران، ایران

رضا رنجبر | ranjbar r
دانشیار، مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه ا... عج ، تهران، ایران

نادر شاهرخی | nader shahrokhi
استادیار، بخش بیولوژی مولکولی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: انستیتو پاستور ایران (Pasteur institute of iran)

نورخدا صادقی فرد | nourkhoda sadeghi fard
دانشیار، مرکز تحقیقات میکروب شناسی بالینی، دانشگاه علوم پزشکی ایلام، ایلام، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی ایلام (Ilam university of medical sciences)

احمد حسنی | ahmad hasani
کارشناس ارشد، گروه میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی علوم و تحقیقات (Islamic azad university science and research branch)

زهره نصرابادی | zohreh nasrabadi
کارشناس ارشد، گروه میکروبیولوژی، دانشکده ی علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج، کرج، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی کرج (Islamic azad university of karaj)

فاطمه پورعلی | fatemeh pourali
کارشناس، مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه ا... عج ، تهران، ایران

نشانی اینترنتی http://jims.mui.ac.ir/index.php/jims/article/view/2455
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/103/article-103-318329.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده مقاله پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات