این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
مجله تازه های بیوتکنولوژی سلولی - مولکولی، جلد ۳، شماره ۹، صفحات ۱۹-۲۷
عنوان فارسی مطالعه مولکولی و آنالیز توالی ژن Wdhn۱۳ (LEA) در گندم های زراعی نان، دوروم و گونه های دهنده ژنومی آنها
چکیده فارسی مقاله سابقه و هدف : پروتئین‌های LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین‌های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. بیشتر دسته بندی‌های عمومی ژن‌های LEA به وسیله استنباط از ساختار دمین های پروتئینی یا ویژگی های شیمیایی بدست می‌آید. روش‌های بیو انفورماتیکی روش‌های مفیدی برای مطالعه ژنوم در شرایط خارج آزمایشگاهی می‌باشند. مواد و روشها : در این تحقیق جهت مطالعه ژن Wdhn13 پروتئین های LEA درگونه های مختلف گندم از 8 گندم زراعی و وحشی(شامل سرداری، نان گنبد، دوروم شوش، دورورم بروجرد، اورارتو، دیکوکوئیدز،‌ تائوشی و اسپلتوئیدز) استفاده شد و توالی بدست آمده از آنها با تنها توالی ژن Wdhn13 مربوط به گندم نان در پایگاه اطلاعاتی NCBI از طریق نرم افزار های بلاست، CLC و داروین مقایسه شد یافته ها: نتایج آنالیز نشان داد که توالی ژن Wdhn13 در گندم سرداری با توالی ژن Wdhn13 مربوط به گندم نان موجود در NCBI بیشترین شباهت و توالی ژن Wdhn13 در گندم اورارتو کمترین شباهت را با توالی ژن Wdhn13 مربوط به گندم نان موجود در NCBI دارد. علت این تفاوت هم تغییرات در اسید های آمینه بر اساس تغییرات در توالی DNA نمونه ها می باشد. همردیفی از طریق نرم افزار BLAST و درخت فیلوژنتیکی رسم شده بر اساس الگوریتم UPGMA نیز موید این نتیجه بودند. همچنین درخت فیلوژنتیکی رسم شده سیر تکاملی منطقی را در ارتباط با این ژن برای اشتقاق گونه های دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید از یکدیگر نشان داد. جدول فاصله توالی ها نیز موید این بود که نتایج BLAST و درخت فیلوژنتیک بر هم منطبق می باشند نتیجه گیری : نتایج این تحقیق نشان داد که با توجه به تکثیر ژن مورد نظر بر روی ژنوم های دیپلوئید اورارتو( AA ) و گونه های تتراپلوئید و هگزاپلوئید شامل ژنوم AA و عدم تکثیر برروی گونه های اسپلتوئیدز ( BB ) و تائوشی( DD ) می توان نتیجه گرفت که ژن Wdhn13 بر روی ژنوم AA گندم قرار دارد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله گندم، ژن Wdhn13 ، پروتئین LEA
عنوان انگلیسی The Molecular Study and Sequence Analysis of Wdhn13 (LEA) Gene in Common, Durum Wheat and Their Ancestral Genome Donor Species
چکیده انگلیسی مقاله Aim and background. LEA proteins in wheat and cotton were identified and discussed as the first report in late embryonic proteins . Public classification for more LEA genes was inferred from the structure of the protein domain or chemically derived characters. Bioinformatics methods in genome research methods are useful in situations outside the laboratory . Material and Methods. In this study, LEA proteins for Wdhn13 genes in 8 wheat and wild wheat (including Triticum aestivum cv. Sardari, aestivum gonbad, durum Shosh, durum borojerd, urartu, dicocoides, tauschii and speltoides) were used and sequences from Wdhn13 was compared with Single gene sequences of Wdhn13 in NCBI Results. The result of analysis showed that the Wdhn13 gene sequences in Sardari wheat were the most similar to the sequences in NCBI and the Wdhn13 gene sequences in urartu have the lowest similarity to the sequences in NCBI one. This difference is due to amino acid changes in the DNA sequence of samples . BLAST and Phylogenetic tree drawn from DNA sequence based on the UPGMA algorithm also confirmed this result. The Phylogenetic tree drawn with the logical evolution of the gene for the derivation of diploid species, and hexaploid, tetraploid was indicated. The table of sequence also confirmed that the sequence of the BLAST results and Phylogenetic trees are consistent over the time. Conclusion.The main result of this study was that given the amplification of target gene on the genomes of diploid, tetraploid and hexaploid species including genome AA and non-amplification on Species speltoides (BB) and tauschii (DD), it can be concluded that there is a target gene on the AA wheat genome.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Wheat, Wdhn13 gene, LEA Protein
نویسندگان مقاله مهران فلک ناز | mehran falaknaz
plant breeding of ilam university, ilam, iran
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه ایلام
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه ایلام (Ilam university)

علی اشرف مهرابی | ali ashraf mehrabi
agronomy and plant breeding department, ilam university, ilam, iran
گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه ایلام
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه ایلام (Ilam university)

دانیال کهریزی | danial kahrizi
agronomy and plant breeding department, razi university, kermanshah, iran
دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه رازی کرمانشاه
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه رازی (Razi university)

علی اصغر نصراله نژاد | aliasghar nasrollah nejad
agronomy and plant breeding department, agricultural sciences amp;amp; natural resources university of groan
گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

خیراله یاری | kheir elah yari
medical biology research center, kermanshah university of medical sciences
مرکز تحقیقات بیولوژی پزشکی دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه (Kermanshah university of medical sciences)

نشانی اینترنتی http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-61-47&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1816/article-1816-284749.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده سلولی و مولکولی
نوع مقاله منتشر شده مقاله تحقیقی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات