این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
علوم دامی ایران، جلد ۵۱، شماره ۳، صفحات ۲۲۱-۲۲۹
عنوان فارسی مطالعه پیوستگی سراسری ژنوم با صفات تولید شیر و معیار سلول‌های بدنی گاوهای هلشتاین ایران
چکیده فارسی مقاله در پرورش گاوشیری هدف اصلی افزایش سود است. افزایش بیماری ورم‌پستان از مشکلات اصلی پرورش گاوشیری با کاهش طول‌عمر تولیدی و افزایش هزینه‌ها، سبب تحمیل زیان‌های اقتصادی جدی به این صنعت شده‌است. این مطالعه باهدف بررسی معماری ژنتیکی و شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با صفات تولیدشیر و تعداد سلول‌های بدنی به‌عنوان یکی از شاخص‌های ارزیابی کیفیت شیر و معیاری غیرمستقیم از بیماری ورم‌پستان، انجام شده‌است. برای بررسی ارتباط و شناسایی پنجره‌های ژنومی اصلی، از روش مطالعه پیوستگی سراسری ژنوم یک‌مرحله‌ای با داده‌های ژنومی 1938 راس گاو نر استفاده شد. نتایج براساس واریانس ژنتیکی افزایشی پنجره‌‌های 5/1 مگابازی از SNP‌‌های مجاور ارائه شده است. پنجره‌هایی که بیش از 1% واریانس را کنترل می‌کنند به‌عنوان نواحی ژنومی اصلی و جهت یافتن ژن‌های کاندیدا استفاده شدند. تعداد 11 پنجره ژنومی اصلی روی 9 کروموزوم اتوزوم، حاوی 94 ژن کاندیدا حدود 20% واریانس ژنتیکی معیار سلول‌های بدنی را توصیف می‌کردند. بیشترین واریانس مربوط به پنجره‌ای روی کروموزوم 14 (85/3%) بود. تعداد 6 پنجره اصلی روی 6 کروموزوم شامل 89 ژن کاندیدا، مرتبط با تولیدشیر بودند. این پنجره‌ها 8/8% واریانس و مهم‌ترین پنجره روی کروموزوم 10، حدود 08/2% واریانس را کنترل می‌نمودند. درخصوص مقدار چربی و پروتئین شیر، به‌ترتیب تعداد 9 منطقه روی 7 کروموزوم، حدود 6/15% و 9 پنجره روی 8 کروموزوم، حدود 6/10% از واریانس را توصیف می‌کردند. نتایج نشان داد که 4 ناحیه ژنومی اثر پلیوتروپی دارند. یافته‌های این تحقیق می‌تواند به‌عنوان منبع اطلاعاتی مهمی در ارزیابی‌های ژنومی صفات تولید شیر و تعداد سلول‌های بدنی باشد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله پنجر‌ه‌های ژنومی،ژن‌های کاندیدا،معیار سلول‌های بدنی،هلشتاین،
عنوان انگلیسی Genome-wide association study for milk production and somatic cell score traits in ‎Iranian Holstein cattle
چکیده انگلیسی مقاله The main objective of dairy farmers is to maximize their profit. Increased incidence of mastitis in farms is one of the health problems, causing in serious economic losses as a consequence of treatment costs and reduction of production and longevity. The objective of this study was to evaluate the genetic architecture and associated genomic regions with milk production and somatic cell score (SCS) as an indirect measure of mastitis and the quality of raw milk. Thus, an SNP data set from 1938 Holstein bulls were used in a single-step genome-wide association study. The proportion of additive genetic variance (agv) for each of 1.5-Mb genomic window (adjacent SNPs) was used to identify informative genomic regions, accounting for more than 1% of the agv. A total of 11 significant windows over 9 bovine autosomes were found for the SCS. A peak on BTA14 explained the largest proportion of variance (3.85%). These regions together, explained 20% of agv and harbored 94 candidate genes. For milk yield, we identified 6 informative windows across 6 chromosomes, and a peak on BTA10 explained 2.08% of agv. These regions, explained 8.8% of the agv and sheltered 89 candidate genes. For the fat yield, 9 significant windows were identified on 7 chromosomes and explained 15.6% of agv, and 9 windows contained 87 candidate genes on 8 bovine autosomes were associated with milk protein yield (10.6% of agv). Four genomic regions had a pleiotropic effect. These findings can be an important source of information in genomic evaluation of dairy cattle.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله پنجر‌ه‌های ژنومی,ژن‌های کاندیدا,معیار سلول‌های بدنی,هلشتاین
نویسندگان مقاله رستم پهلوان |
دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران

محمد مرادی شهربابک |
استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران

اردشیر نجاتی جوارمی |
استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران

رستم عبداللهی آرپناهی |
محقق، دانشگاه فلوریدا، آمریکا ‏

نشانی اینترنتی https://ijas.ut.ac.ir/article_78955_5e815e7b3b72aec7732a7d18970b70ce.pdf
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات