این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
پژوهش های تولیدات دامی، جلد ۱۳، شماره ۳۶، صفحات ۰-۰
عنوان فارسی کاهش معنادار بیان ژنهای مرتبط با فرآیندهای متابولیکی پس از آلودگی با انگلهای ایمریایی در طیور؛ نتایج بازآنالیز داده‌های ریزآرایه‌ای
چکیده فارسی مقاله مقدمه (و هدف): اهلی‌سازی طیور، آنها را به بزرگترین تولید کننده گوشت در جهان تبدیل کرده است. پرورش متراکم طیور، آنها را در مقابل بسیاری از عوامل بیماری‌زا آسیب‌پذیر ساخته است. بیماری کوکسیدیوز یکی از پر هزینه‌ترین بیماری‌های صنعت طیور به شمار می‌رود. شناخت نحوه پاسخ ایمنی بدن به کوکسیدیوز، می‌تواند در طراحی روشهای پیشگیرانه و درمانی در مقابل آن، کمک‌کننده باشد. هدف این مطالعه، شناسایی ژنهای مهم دخیل در پاسخ سیستم ایمنی طیور به آلودگی با انگلهای ایمریا با استفاده از داده‌های ریزآرایه‌ای موجود در پایگاه‌های عمومی داده می‌باشد. مواد و روش‌ها: در مطالعه حاضر، پس از جستجوی پایگاه اطلاعاتی GEO، دو مجموعه داده ریزآریه‌ای مرتبط با کوکسیدیوز در طیور انتخاب شد. پس از کنترل کیفی و حذف داده‌های نامناسب، با استفاده از بسته LIMMA در برنامه R به شناسایی ژنهای با بیان بالا و پایین معنادار در پاسخ به آلودگی با ایمریاها پرداخته شد. آنالیز ژن آنتولوژی و مسیرهای KEGG با استفاده از برنامه DAVID اجرا شد. شبکه ارتباط متقابل پروتئین-پروتئین مربوط به ژنهای با تغییر سطح بیان معنادار شده، با استفاده از برنامه Cytoscape ترسیم شد. یافته‌ها: نتایج بدست آمده نشان دادند که اغلب ژنهایی که دچار افزایش بیان معنادار شده بودند، در دسته ژنهای مرتبط با سیستم ایمنی ذاتی قرار داشتند. ژنهای با کاهش بیان معنادار نیز در فرآیندهای متابولیکی دخیل بودند. به نظر می‌رسد بیماری کوکسیدیوز به دلیل آسیب به روده طیور، بیشترین اثر منفی خود را بر فرآیندهای متابولیکی از جمله متابولیسم چربی می‌گذارد. افزایش بیان معنادار ژنهای MMP1، MMP7 و MMP9 نشان داد که کاتابولیسم کلاژن در بیماری کوکسیدیوز یکی از موارد افزایش یافته می‌باشد که می‌تواند ناشی از آسیب به بافت روده باشد. نتیجه‌گیری: به نظر می‌رسد تغییر سطح بیان ژنهای موثر در متابولیسم برخی از مواد مغذی از جمله چربی‌ها، یکی از تاثیرات مهم بیماری کوکسیدیوز باشد. نتایج به دست آمده در مطالعه کنونی می‌تواند در درک بهتر نحوه پاسخ سیستم ایمنی طیور به بیماری کوکسیدیوز مفید باشد. تغییرات مشاهده شده در بیان برخی از ژنها می‌تواند به طراحی روشهای درمانی این بیماری کمک کند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله ایمریا، بیان ژن، زیان اقتصادی، سلامت عمومی، صنعت مرغداری، کوکسیدیوز
عنوان انگلیسی Significantly decrease in the expression of genes related to metabolic processes after infection with Eimeria parasites in poultry; Results of microanalysis data re-analysis
چکیده انگلیسی مقاله Introduction (and aim): Poultry domestication has made them the largest meat producer in the world. The intensive breeding of poultry has made them vulnerable to many pathogens. Coccidiosis caused by Eimeria parasites is one of the most costly diseases in the poultry industry. Understanding how the immune system responds to coccidiosis can be helpful in designing prevention and treatment methods against it. The aim of this study was to identify the important genes involved in the response chicken's immune system to infection with Eimeria parasites using microarray data available in public databases. Material and Methods: In the present study, after searching the GEO database, two microarray datasets related to coccidiosis in poultry were selected. After quality control and removal of inappropriate data, significantly up- and down-regulated genes in response to infection with Eimeria were identified using the LIMMA package in the R program. Gene ontology and KEGG pathways analysis were performed using the DAVID program. The protein-protein interaction network of the genes with significant expression level changes was constructed using the Cytoscape program. Findings: The obtained results showed that most of the genes that had a significant increase in expression level were associated with the innate immune system. Significantly down-regulated genes were also involved in metabolic processes. It seems coccidiosis has the greatest negative effect on metabolic processes, including fat metabolism, due to damage to the poultry intestine. A significant increase in the expression of MMP1, MMP7 and MMP9 genes revealed that collagen catabolism in coccidiosis is one of the increased cases that can be caused by damage to intestinal tissue. Conclusion: It seems that changing the expression level of genes affecting the metabolism of some nutrients, including fats, is one of the important effects of coccidiosis. The obtained results of the present study can be useful in better understanding how the poultry's immune system responds to coccidiosis. The observed changes in the expression of some genes can help design treatments for this disease.  
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Eimeria, Gene expression, Economic loss, Public health, Poultry industry, Coccidiosis
نویسندگان مقاله رضا سیدشریفی | Reza Seyedsharifi
University of Mohaghegh Ardabili
دانشگاه محقق اردبیلی

رضا خلخالی ایوریق | Reza Khalkhali-Evrigh
University of Mohaghegh Ardabili
دانشگاه محقق اردبیلی

نعمت هدایت | Nemat Hedayat
University of Mohaghegh Ardabili
دانشگاه محقق اردبیلی

نشانی اینترنتی http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-619-3&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده ژنتیک و اصلاح نژاد طیور
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات