این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
زیست فناوری، جلد ۱۲، شماره ۱، صفحات ۸۹-۱۰۱
عنوان فارسی پیش بینی بیوانفورماتیکی microRNA های تنظیم کننده فرایند EMT در سلول های سرطانی
چکیده فارسی مقاله هدف: EMT فرایندی برگشت­پذیر و ضروری در طول جنین‌زایی، بهبود زخم و پیشرفت سرطان است. در بسیاری از سرطان‌ها، EMT می‌تواند ویژگی­های تهاجمی تومور را افزایش دهد. اخیراً miRNAها به‌عنوان کلاس جدیدی از‌RNA های غیر کدکننده­ تنظیم­گر بیان ژن در مراحل پس از ترجمه دخیل در فرایندEMT   شناخته می­شوند. بـااین‌حال، مکانیسم و اثر دقیق miRNAها در فرایند EMT در سلول‌های سرطانی انسان هنوز به‌خوبی مشخص نیست. این مطالعه با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک پیش‌بینی‌کننده miRNAهای تنظیم‌کننده ژن‌های اصلی در فرایندEMT ، تلاش می‌کند نقش miRNAها را در فرایند EMT روشن کند. مواد و روش‌ها: در این مطالعه، با استفاده از پایگاه‌های داده­های تحت وب و ابزارهای پیش‌بینی برهم‌کنش miRNAها نظیر DIANA، TargetScan و miRSystem، برهم‌کنشmiRNAهای تنظیم‌کننده ژن­های N-cadherin ، TWIST1، ZEB1، SNAIL و Vimentin به عنوان بیومارکرهای اصلی سلول‌های مزانشیمی بررسی شد. نتایج: اثرات miRNAهای متفاوت براساس الگوریتم هر پایگاه بر ژن‌های نامزد بررسی و داده‌های به‌دست‌آمده از پایگاه‌های مختلف باهم اشتراک گرفته شد. نتایج نشان داد که یازده miRNA با احتمال بالا به‌طورمشترک می­توانند در فرایند EMT/MET نقش داشته باشند. ﻧﺘﯿﺠﻪ‌ﮔﯿﺮی: براساس یافته‌های ما، می­توان پیش‌بینی کرد که با توجه به نمره بالاmiRNA های انتخاب‌شده با ژن‌های نامزد، این miRNAها می­توانند نقشی مهم در فرایند EMT/MET داشته باشد. ازاین‌رو، می‌توان از آنها به‌عنوان کاندیدهای مناسب برای تحقیقات بالینی آینده استفاده کرد.   کلمات کلیدی: EMT،MET ، TargetScan، miRSystem، microRNA
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Bioinformatics Prediction of microRNAs Regulating Epithelial-to-Mesenchymal Transition in Cancer Cells
چکیده انگلیسی مقاله  ABSTRACT Aims: Epithelial to mesenchymal transition (EMT) is an essential step in the developmental process, wound healing and cancer progression. In many cancers, EMT can increase aggressive properties including invasion, metastasis and Tumor resistance to apoptosis. Recently, miRNAs as a new class of non-coding RNAs that post-transcriptionally regulate gene expression have been demonstrated to have a crucial role in the regulation of EMT. However, the detailed mechanisms of miRNAs involvement in EMT in human cancer cells are still unclear. This study aimed to clarify this issue by using bioinformatics tools for predicting competent miRNAs target the main gens in EMT. Materials and Methods:  To ascertain an effective miRNA for the EMT, we assessed five genes from EMT/MET as key genes. Then, to predict the most suitable miRNA: target interactions, different online databases including DIANA, TargetScan, and miRSystem were applied. Results: Possible targeting effects of different miRNAs on candidate genes were analyzed. Merging data from databases has shown that 11 miRNAs with strong possibility communally can be involved in EMT/MET. Conclusion: To conclude, it can be predicted that according to high interaction scores of these elected miRNAs with candidate genes in the above-mentioned databases, these miRNAs probably can have critical roles in EMT/MET. Hence, these miRNAs can be introduced as appropriate candidates for future investigations.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله microRNA,miRSystem,TargetScan,EMT,MET
نویسندگان مقاله صدیقه سادات مرتضوی | Sedigheh Sadat Mortazavi
Department of Biology, Faculty of Sciences, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran
ﮔﺮوه زیست ﺷﻨﺎﺳﯽ، دانشکده علوم پایه،دانشگاه شهید باهنر کرمان

صدیقه غربی | Sedigheh Gharbi
Department of Biology, Faculty of Sciences, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran
ﮔﺮوه زیست ﺷﻨﺎﺳﯽ، دانشکده علوم پایه،دانشگاه شهید باهنر کرمان ، Gharbi@uk.ac.ir

مریم شاه علی | Maryam Shahali
Department of Quality Control, Research and Production Complex Pasteur Institute of Iran, Tehran
بخش کنترل کیفیت، مجتمع تولیدی تحقیقاتی انستیتو پاستور ایران

نشانی اینترنتی http://biot.modares.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-47380-1&slc_lang=fa&sid=22
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات