مجله دانشگاه علوم پزشکی کردستان، جلد ۱۶، شماره ۱، صفحات ۵۶-۶۳
عنوان فارسی بهینه نمودن تکنیک تکثیر هم دما به واسطه لوپ (LAMP) جهت تشخیص ویروس هرپس سیمپلکس تیپ ۱ و ۲
چکیده فارسی مقاله چکیده زمینه و هدف: ویروس هرپس سیمپلکس تیپ 1 و 2 عامل ایجاد عفونت سیستم عصبی مرکزی (آنسفالیت) در انسان می‌باشد. روشهای مولکولی، بهترین روش تشخیص این عامل بیماریزا می‌باشند. در این مطالعه تکنیک مولکولی جدید LAMP جهت تشخیص هر دو تیپ این ویروس مورد ارزیابی قرار گرفت. روش بررسی: در یک مطالعه تجربی، 184 نمونه مایع مغزی- نخاعی (CSF) از بیمارستان مفید تهران تهیه شد. DNA نمونه‌ها بوسیله کیت DNP سیناژن استخراج شد. یک دسته 6 تایی پرایمر، ویژه ژن DNA پلیمراز ویروس HSV طراحی و تست‌های حساسیت و ویژگی این تکنیک انجام گردید. محصول واکنش LAMP با افزودن سایبرگرین مورد تایید قرار گرفت. نتایج تکنیک LAMP با نتایج تکنیک PCR بوسیله آزمون مربع کای مقایسه شد. یافته‌ها: حساسیت تکنیک بهینه شده LAMP تا 5 پارتیکل ویروس و حساسیت تکنیک PCR تا 50 پارتیکل ویروس تعیین گردید. هر دو تکنیک LAMP و PCR در تشخیص تیپ 1و 2 ویروس HSV، از ویژگی 100% برخوردار بودند. از 184 نمونه CSF، تکنیک LAMP 60 نمونه را مثبت تشخیص داد در حالیکه 45 نمونه با تکنیک PCR، مثبت گزارش شدند. حساسیت تکنیک LAMP، 10 برابر بالاتر از تکنیک PCRبه دست آمد. مقایسه بین نتایج دو روش با استفاده از آزمون مربع کای نشان داد این دو روش در سطح معنی دار p< 0.05 با یکدیگر تفاوت دارند. نتیجه‌گیری: تشخیص دو تیپ 1و 2 ویروسHSV موجود در نمونه‌های C‏SF ، بوسیله تکنیک LAMP از حساسیت و ویژگی بالایی برخوردار است. کلید واژه‌ها: ویروس هرپس سیمپلکس، LAMP، مایع مغزی - نخاعی وصول مقاله: 1/9/89 اصلاحیه نهایی: 6/11/89 پذیرش مقاله: 24/11/89
کلیدواژه‌های فارسی مقاله ویروس هرپس سیمپلکس، LAMP، مایع مغزی - نخاعی
عنوان انگلیسی Optimization of Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) method for detection of herpes simplex virus type 1 and 2
چکیده انگلیسی مقاله ABSTRACT Background and Aim: Type 1 and type 2 herpes simplex (HSV) virus cause infection of central nervous system (encephalitis) in human. The molecular techniques are the best methods for detection of HSV. In this study we evaluated the novel molecular technique of LAMP for detection of HSV-1 and HSV-2. Material and Methods: In this experimental study 184 cerebrospinal fluid (CSF) samples were collected from Mofid Hospital. DNA of every sample was extracted by use of Sinagen DNP Kit. Based on the HSV DNA polymerase gene, a set of 6 primers were designed and sensitivity and specificity of this method were determined. By adding SYBER Green, LAMP product was identified. The results of LAMP method were compared to those of PCR by chi-square test. Results: Sensitivity of LAMP method determined to be 5 copies/ tube and sensitivity of PCR method determined to be 50 copies/ tube. Both LAMP and PCR methods showed 100% specificity for detection of HSV type 1 and type2. Among 184 samples, 60 samples were positive by LAMP but 45 samples were positive by PCR method. Sensitivity of LAMP was 10 times higher than that of PCR. Comparison of the results of the two methods by means of chi-square test showed a significant difference (p‹0.05). Conclusion: LAMP method had high sensitivity and specificity for detection of type 1 and type 2 HSV in CSF samples. Key word: HSV, LAMP, CSF Conflict of Interest: Nill Received: Nov 22, 2010 Accepted: Jan 14, 2011
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله HSV, LAMP, CSF
نویسندگان مقاله اسمای بهرامی | asmaa bahrami
msc of microbiology, islamic azad university, science amp;amp; research branch, tehran, iran.
دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه زیست شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی علوم و تحقیقات (Islamic azad university science and research branch)

محمد حسن شاه حسینی | mohammad hasan shahhosseiny
microbiology dept., islamic azad university, shahr-e- qods branch, iran
گروه میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهر قدس، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی شهر قدس (Islamic azad university of shahr e qods)

کیهان آزاد منش | kayhan azadmanesh
virology dept., pasteur institute of iran, tehran, iran.
گروه ویروس شناسی، انستیتو پاستور تهران، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: انستیتو پاستور ایران (Pasteur institute of iran)

زهرا نورمحمدی | zahra noormohamadi
biology dept., islamic azad university, science amp;amp; research branch, tehran, iran.
گروه زیست شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی علوم و تحقیقات (Islamic azad university science and research branch)

الهام مسلمی | elham moslemi
biology dept., islamic azad university, east tehran branch,tehran, teran, iran.
گروه زیست شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران شرق، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی تهران شرق (Islamic azad university of tehran east)

فرزانه جدلی | farzaneh jadali
pathology dept., mofid hospital of tehran, tehran, iran.
بخش پاتولوژی بیمارستان کودکان مفید، تهران، ایران

نشانی اینترنتی http://sjku.muk.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-281&slc_lang=fa&sid=en
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده عمومی
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات