|
|
کومش، جلد ۱۸، شماره ۱، صفحات ۳۵-۴۱
|
|
|
| عنوان فارسی |
آنالیز شبکه برهم کنش پروتئین - پروتئین سلول‌های فیبروبلاست انسانی تیمار شده با الکل اتانول |
|
| چکیده فارسی مقاله |
سابقه و هدف: مطالعات انجام شده نشان می‌دهد که اتانول بیان پروتئین‌ها متعددی را در سلول‌های فیبروبلاست تغییر می‌دهد. تعدادی از این پروتئین‌ها از فاکتورهای مهم در سرطان‌زایی هستند. بنابراین، آنالیز نقش عمل‌کردی و برهم‌کنش این دسته از پروتئین‌ها به منظور شناسایی مکانیسم‌های عمل‌کردی و سرطان‌زایی الکل دارای اهمیت است. مواد و روش‌ها: در این تحقیق با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape و الگوریتم‌های وابسته، شبکه برهم‌کنش پروتئینی، شش پروتئین شناسایی شده در پروتئوم سلول‌های فیبروبلاست (HFFF2) تیمار شده با الکل اتانول که تغییرات کاهشی محسوسی داشته‌اند آنالیز شد. یافته‌ها: با توجه به بررسی‌های به‌دست آمده شبکه برهم‌کنش پروتئینی به‌دست آمده شامل 756 گره و 1166 اتصال است. نتایج نشان می‌دهند که Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 با 528=Degree و 74/0=Betweenness centrality پروتئینی کلیدی محسوب می‌شود و الکل سبب اختلال در بیان آن می‌شود. هم‌چنین بر اساس مطالعه کمپلکس‌های پروتئینی، این پروتئین حضور بارزی در کمپلکس‌های مختلف دارد. از سوی دیگر نتایج آنالیز نرم‌افزار DAVID نشان می‌دهد که این پروتئین‌ها در تنظیم بخش عظیمی از فرایندهای درون سلولی مداخله می‌نماید. نتیجه‌گیری: شش پروتئین‌هایی که میزان بیان آن‌ها تحت تاثیر الکل تغییر یافته است علاوه بر آن که می‌توانند خطر ابتلا به سرطان افزایش دهند، فرایندهای درون سلولی متنوعی را نیز مختل می‌کنند که Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 در این میان مهم‌ترین پروتئین است |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
|
|
| عنوان انگلیسی |
Protein-protein interaction network analysis of human fibroblast cells treated with ethanol |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Introduction: Studies show that ethanol can induce changes in proteomic profile of human fibroblast cells. Some of these proteins are important in promoting cancer. Thus, analyzing function and interaction networks of these proteins are essential for better understanding the carcinogenesis mechanism of ethanol. Materials and Methods: In this study the protein-protein interaction network (PPI) of six significant down-regulated proteins in human fibroblast cells (HFFF2) treated with ethanol were analyzed by using Cytoscape software and its algorithms. Results: PPI network analysis showed that the constructed network consisted of 756 nodes and 1166 edges. Results indicated that Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 with degree = 528 and Betweenness Centrality = 0.74 is a hub protein that ethanol can alter its expression. In addition, module evaluation showed that the hub protein has a key role in different overlapped complexes. On the other hand, annotation studies by using DAVID program indicated that this protein is involved in different important biological processes in the cell. Conclusion: The six down-regulated proteins treated with ethanol may become carcinogenic and can impose vast alterations in other vital biological processes of the cell. Among them, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 is the most important one |
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
|
|
| نویسندگان مقاله |
مونا زمانیان عضدی | mona zamanian azodi
faculty of paramedical sciences, shahid beheshti university of medical sciences, tehran, iran
دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی (Shahid beheshti university of medical sciences)
مصطفی رضایی طاویرانی | mostafa rezaei tavirani
proteomics research center, shahid beheshti university of medical sciences, tehran, iran
مرکز تحقیقات پروتئومیکس، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی (Shahid beheshti university of medical sciences)
مریم پیوندی | maryam peyvandi
proteomics research center, shahid beheshti university of medical sciences, tehran, iran
مرکز تحقیقات پروتئومیکس، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی (Shahid beheshti university of medical sciences)
اکرم صفایی | akram safaei
faculty of paramedical sciences, shahid beheshti university of medical sciences, tehran, iran
دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، ایران، تهران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی ایران (Iran university of medical sciences)
مجید رضایی طاویرانی | majid rezaei tavirani
faculty of medicine, iran university of medical sciences, tehran, iran
دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، ایران، تهران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی ایران (Iran university of medical sciences)
محمد محبوبی | mohammad mahboubi
abadan school of medical sciences, abadan, iran
دانشکده علوم پزشکی آبادان، آبادان، ایران
فرشاد اخوتیان | farshad okhovatian
physiotherapy research center, shahid beheshti university of medical sciences, tehran, iran
مرکز تحقیقات فیزیوتراپی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی (Shahid beheshti university of medical sciences)
حسینعلی صفاخواه | hossein ali safakhah
physiology research center and dept. of physiology, faculty of medicine, semnan university of medical sciences, semnan, iran
مرکز تحقیقات و گروه فیزیولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی سمنان، سمنان، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی سمنان (Semnan university of medical sciences)
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://koomeshjournal.semums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2478-3&slc_lang=fa&sid=fa |
| فایل مقاله |
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
عمومی |
| نوع مقاله منتشر شده |
پژوهشی |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|