|
|
پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، جلد ۹، شماره ۲۴، صفحات ۱-۹
|
|
|
| عنوان فارسی |
تجزیه ترانسکریپتوم نخود بومی ایرانی در واکنش به تنش خشکی |
|
| چکیده فارسی مقاله |
نخود (Cicer arietinum L.) علاوه بر اینکه یکی از مهمترین حبوبات از نظر تامین پروتئین برای تغذیه انسان می‌باشد، نقش مهمی در حاصلخیزی خاک دارد. این گیاه در نواحی خشک و نیمه خشک همچون ایران، در معرض تنش خشکی انتهای فصل قرار دارد. شناسایی ژن‌های القا شده در شرایط تنش خشکی نه تنها برای درک مکانیسم‌های مولکولی تحمل بهخشکی ضروری است، بلکه در توسعه گیاهان متحمل اهمیت دارد. در تحقیق حاضر، الگوی ترانسکریپتوم نخود کابلی بومی ایرانی (رقم بیونیج) تحت شرایط خشکی در مرحله اوایل گلدهی در مرکز بین‌المللی تحقیقات گیاهان زراعی برای نواحی گرمسیری نیمهخشک (ICRISAT) بررسی شد. بهمنظور توالی‌یابی ترانسکریپتوم نمونه‌های ریشه و اندام هوایی در شرایط شاهد و تنش از Illumina HiSeq2500 استفاده شد. در مجموع تعداد 891 و 507 ژن با بیان افتراقی در پاسخ بهتنش خشکی بهترتیب در ریشه و اندام هوایی شناسایی شدند. همچنین تعداد 760، 376 و 131 ژن بهترتیب بهصورت اختصاصی در ریشه، اندام هوایی و مشترک در هر دو اندام بیان شدند. تجزیه ژن آنتولوژی (GO)، چندین گروه GO مربوط بهتنش، شامل واکنش بهمحرک‌ها و پیام‌رسانی را در ژن‌های بیان شده افتراقی در پاسخ بهتنش خشکی شناسایی کرد. علاوه بر این، مسیرهای متابولیکی مهم، نظیر بیوسنتز اسید آبسزیک و پرولین، بیوسنتز متابولیت‌های ثانویه مثل فلاوونوئیدها و فنیل‌پروپانوئیدها و متابولیسم‌های انرژی و کربوهیدارت‌ها از طریق تجزیه مسیر KEGG شناسایی شدند. یافته‌های این تحقیق نشان داد که ژن‌ها و مسیرهای بیشتری در ریشه نسبت به اندام هوایی درگیر بودند. چندین ژن بیان شده افتراقی بویژه آن‌هایی که بهعنوان عوامل رونویسی در ارتباط با ژن‌های واکنشدهنده بهخشکی عمل کردند را می‌توان در تحقیقات آتی و برای بهبود ارقام متحمل به خشکی استفاده کرد. |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
نخود، خشکی، RNA-Seq، مسیرهای متابولیکی، عوامل رونویسی |
|
| عنوان انگلیسی |
Transcriptome Analysis of Iranian Local Chickpea in Response to Drought Stress |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Chickpea (Cicer arietinum L.) is one of the most important legumes for human food and plays major roles in soil productivity. This crop is subjected to terminal drought in arid and semi-arid regions such as Iran. Identification of drought-induced genes is necessary not only for understanding molecular mechanisms of drought tolerance, but also is important to develop tolerant crops. In present study, transcriptome profiling of Iranian local kabuli chickpea (Bivanij cultivar) was investigated under drought stress at early flowering stage at International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT). Illumina HiSeq2500 was applied for sequencing the root and the shoot samples under control and stress conditions. A total of 891 and 507 differentially expressed genes (DEGs) were identified in response to the drought stress in the root and the shoot, respectively. Likewise, 760, 376 and 131 DEGs were detected specifically in the root, the shoot and common in both organs, respectively. Gene ontology (GO) analysis revealed several GO terms associated with stress, including response to stimulus and signaling among the DEGs in response to the drought stress. Moreover, major metabolic pathways such as ABA and proline biosynthesis, biosynthesis of secondary metabolites such as flavonoids and phenylpropanoids, carbohydrates and energy metabolisms were identified by KEGG pathway analysis. These findings showed that more drought-related genes and pathways were induced in the root compared to the shoot. Several DEGs particularly those which were functioned as transcription factors (TFs) related to drought responsive genes, can be used for future researches and improving drought tolerant cultivars. |
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
|
|
| نویسندگان مقاله |
کیوان مهدوی ماشکی | Keyvan Mahdavi Mashaki
علی اصغر اصغر نصراله‌نژاد قمی | Ali Asghar Nasrollahnezhad Ghomi
ماهاندر تودی | Mahendar Thudi
خلیل زینلی‌نژاد | Khalil Zaynali Nezhad
احمد یامچی | Ahad Yamchi
حسن سلطانلو | hasan Soltanloo
راجیو کومار وارشنی | Rajeev Kumar Varshney
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-296&slc_lang=fa&sid=fa |
| فایل مقاله |
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1462/article-1462-576479.pdf |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
اصلاح نباتات، بیومتری |
| نوع مقاله منتشر شده |
پژوهشی |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|