این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
علوم باغبانی ایران، جلد ۴۹، شماره ۲، صفحات ۳۱۳-۳۲۱
عنوان فارسی ردیابی و معرفی نشانگرهای ریزماهواره در گیاه شاهدانه با کاوش در ترنسکریپتوم
چکیده فارسی مقاله گیاه شاهدانه یکی از مهم‌ترین گیاهان ازنظر اقتصادی برای تولید دارو، غذا، فیبر و روغن است. بااین‌حال نبود نشانگرهای کافی و مؤثر ریزماهواره، گسترش بررسی‌های ژنتیکی این گیاه را محدود کرده است. در این پژوهش داده‌های ترنسکریپتوم برای شناسایی و معرفی ریزماهواره­ها به‌منظور بررسی تنوع ژنتیکی و تفکیک رقم‌ها و جمعیت­های فیبری و دارویی استفاده شد. بر پایۀ این داده‌ها 3388 مکان ریزماهواره از 1402 توالی در رقم فیبری و 10381 مکان از 4743 توالی در رقم دارویی شناسایی شد. در میان این نشانگرها موتیف‌های سه نوکلئوتیدی و پس از آن تک و دو نوکلئوتیدی بالاترین فراوانی را نشان دادند. آغازگرهای مناسب برای افزونش 234 ریزماهواره از 152 توالی منحصر در رقم فیبری و 1543 ریزماهواره از 1372 توالی مختص در رقم دارویی طراحی شدند. این بررسی نخستین ارزیابی در مقیاس گسترده برای شناسایی نشانگرهای ریزماهواره از توالی­های ترنسکریپتوم در گیاه شاهدانه است. تأثیر این نشانگرهای مولکولی می­تواند با استفاده از جمعیت­های موجود در ایران آزمون و ارزیابی شده و کارایی آن­ها در اصلاح این جمعیت­ها بررسی شود.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Tracing and introducing SSR markers in Cannabis sativa by exploring in transcriptome
چکیده انگلیسی مقاله Cannabis sativa L. is an important economic plant for the production of medical, food, fiber and oils. Nevertheless, lack of sufficient simple sequence repeat (SSR) markers has limited the development of cannabis genetic research. In this study, transcriptome sequences were used for identification and introduction of SSR markers in order to assess genetic diversity and separation of fiber and drug types. Based on the cannabis RNA-Seq data, 3383 SSR were identified from 1402 reads in fiber type whiles this number was 10381 for 4743 reads in drug type. Among these markers, trinucleotide repeat motifs were the most abundant, followed by mononucleotide and dinucleotide. Primers were successfully designed for amplification of 234 SSR markers from 152 individual sequences in fiber and 1543 SSR markers from 1372 individual sequences in drug using Primer3 with default parameters. This study outlines the first large-scale development of SSR markers for cannabis. The effectiveness of these molecular markers should be tested using different Iranian Marijuana populations and could be particularly useful for cannabis populations breeding.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله ابوذر سورنی |
دانشجوی دکتری، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

سید علیرضا سلامی |
استادیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

محمد رضا فتاحی مقدم |
استاد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

نشانی اینترنتی https://ijhs.ut.ac.ir/article_67797_bb2208957bce3068b27e3bea28d2de6e.pdf
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/949/article-949-902130.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات