این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
چهارشنبه 14 آبان 1404
پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی
، جلد ۱۰، شماره ۲۵، صفحات ۱۱۰-۱۱۷
عنوان فارسی
ارزیابی راندمان تعدادی از ژنهای مرجع در آلوروپوس تحت شرایط تنش شوری
چکیده فارسی مقاله
استفاده از گونههای وحشی گیاهان زراعی یا خویشاوندان هالوفیت آنها در برنامههای اصلاحی بهمنظور توسعه ارقام زراعی متحمل به شوری و خشکی میتواند نتایج مفیدی را به دنبال داشته باشد. اخیرا گیاه آلوروپوس بهعنوان یک مدل هالوفیت برای شناسایی و جداسازی ژنهای جدید متحمل به شوری مورد توجه محققان قرار گرفته است. در میان روشهای مورد استفاده برای مطالعات بیان ژن، واکنش زنجیرهای پلیمراز زمان واقعی یکی از روشهای مناسب برای ارزیابی میزان بیان ژن است. در این روش کنترل خطا بین نمونهها ضروری به نظر میرسد. روشی که به صورت گسترده برای کنترل خطا مورد استفاده قرار میگیرد، نرمال کردن سطوح RNA با یک ژن مرجع یا خانهدار میباشد. در این تحقیق بهمنظور بررسی پایداری بیان ژنها در اندامهای برگ و ریشه گیاه آلوروپوس، 7 ژن مرجع تحت شرایط تنش شوری مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل دادهها با استفاده از نرمافزار geNorm نشان داد که ژنهای ACT11، Beta actin و Beta tubulin در برگ و ژنهای Beta tubulin و Beta actin در ریشه دارای بیشترین میزان پایداری هستند. بر اساس آماره توصیفی ژن ACT11 دارای بیشترین همبستگی (836/0 و 722/0 به ترتیب در ریشه و برگ) با شاخص BestKeeper بود. همچنین با توجه به نتایج این برنامه، ژن Beta tubulin در برگ و ریشه دارای بیشترین پایداری (کمترین ضریب تغییرات) بود. بنابراین میتوان عنوان کرد که ژنهای Beta tubulin، Beta actin و ACT11 میتوانند بهعنوان ژنهای مرجع مناسب در گیاه آلوروپوس بهمنظور نرمالسازی دادههای بیانی مورد استفاده قرار بگیرند.
کلیدواژههای فارسی مقاله
عنوان انگلیسی
Validation of some of Housekeeping Genes in Aeluropus littoralis under Salinity Stress
چکیده انگلیسی مقاله
Application of wild type crops or wild relatives' cultivars that are halophyte in plant breeding program would provide better results in order to develop cultivars that are resistant toward drought as well as salinity. Recently, Aeluropus littoralis has attracted the attention of researcher in order to identify novel genes and their regulatory elements that are involved in salinity stress. Currently, Quantitative polymerase chain reaction (Q-PCR) is one of the best and sensitive techniques in order to determine the expression profiling of genes in plants. In this method, normalizations of the obtained data with appropriate housekeeping genes are certainly crucial. In the current research, the efficiency of seven reference genes to be employed in the normalization of the data was investigated. Statistical analysis of the data was done via geNorm program and it was demonstrated that the ACT11, Beta Actin and Beta tubulin and Beta tubulin and Beta Actin were constitutively expressed in leaf as well as roots, respectively. Based on the gained results through Best Keeper, the ACT11 poses the highest correlations with the BestKeeper (0.836 and 0.722 in leaf and root respectively). Additionally, it was shown that the Beta tubulin has the lowest coefficient variation in term of expression in root and leaf. Taken together, it was evidently demonstrated that the ACT11, Beta Actin and Beta tubulin are the best reference gene to be employed for the normalization of expression data in the Aeluropus littoralis.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله
امین ابراهیمی | Amin Ebrahimi
Shahrood University of Technology
دانشگاه صنعتی شاهرود
سجاد رشیدی منفرد | Sajad Rashidi Monfared
Tarbiat Modares University
دانشگاه تربیت مدرس
امیر مرادی سرابشلی | Amir moradi sarabshelli
Sari Agriculture science and Natural Resource University
دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
پرویز حیدری | Parviz heidari
Shahrood University of Technology
دانشگاه صنعتی شاهرود
نشانی اینترنتی
http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-607-1&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
اصلاح برای تنش های زنده و غیرزنده محیطی
نوع مقاله منتشر شده
پژوهشی
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات