|
|
پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، جلد ۹، شماره ۲۴، صفحات ۹۵-۱۰۲
|
|
|
| عنوان فارسی |
ارزیابی کارایی نشانگر مولکولی SCoT در بررسی تنوع ژنتیکی توده های گیاه دارویی رازیانه (Fueniculum vulgare) |
|
| چکیده فارسی مقاله |
یکی از قدیمیترین گیاهان دارویی رازیانه (Fueniculum vulgare) میباشد که در طب سنتی کاربرد فراوان دارد. در این تحقیق، تنوع ژنتیکی 16 توده ایرانی رازیانه تهیه شده از بانک ژن سازمان جنگلها و مراتع با استفاده از 15 آغازگر SCoT (Start codon targeted) مورد ارزیابی قرار گرفت. آغازگرهای SCoT در مجموع توانستند 77 باند تولید کنند که از این تعداد، 4 باند یکشکل مشاهده شد. آغازگرهای SC5 و SC29 بهترتیب با 10 و 9 باند بیشترین تعداد و آغازگرهای SC10، SC26 و SC44 با 2 باند کمترین تعداد باند را نشان دادند. شاخصهای محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC)، شاخص نشانگری (MI)، نسبت چندگانه موثر (EMR) و شاخص قدرت تفکیک (RP) برای کلیه نشانگرها محاسبه گردید که با توجه به شاخصهای محاسبه شده آغازگرهای SC15 و SC63 بهعنوان بهترین آغازگرها جهت بررسی تنوع ژنتیکی رازیانه معرفی گردید. میزان شباهت ژنتیکی مشاهده شده براساس اطلاعات این نشانگرها برابر 66/0 بود. بیشترین تشابه ژنتیکی در میان توده 6 (اردبیل 1) با تودههای 7 (اردبیل 2) و 8 (تهران 1)، و کمترین تشابه را توده 15 (قزوین) با 5 (یزد) داشت. نتایج حاصل از گروهبندی تجزیه خوشهای بهروش UPGMA بر اساس ضریب تشابه جاکارد تودهها در 4 گروه قرار داد که بر اساس تجزیه به مختصات اصلی (PCo) و تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) گروههای حاصل از تجزیه کلاستر تایید گردید بر طبق این گروهبندی واریانس بین گروهها در سطح 5% معنیدار بود، اما براساس واریانس برآورد شده سهم واریانس بین گروهها تنها 24 درصد از تنوع کل بود. |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
تنوع ژنتیکی، مارکر مولکولی، رازیانه، SCoT |
|
| عنوان انگلیسی |
Genetic Diversity among Fennel (Fueniculum Vulgare Mill.) Landrace using Scot Markers |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Fennel (Foeniculum vulgare Mill.) is one of the well-known medicinal and aromatic plants. To determine variability between 16 Iranian Fennel landrace based on molecular markers, this experiment was conducted in the biotechnology laboratory of Payame Noor University of Kermanshah in 2014. In this experiment, 16 landrace of the Foeniculum vulgare Mill. were selected from the Natural Resources Gene Bank of Iran of Research Institute of Forest and Rangeland. Landrace were evaluated based on 15 SCoT primers markers. All of the SCot primers showed 77 visible bands in which four bands were similar patterns. The SC5 and SC29 primers had the most number of bands with 10 and 9 bands respectively, while SC10, SC26 and SC44 with two bands showed the least band numbers. The Polymorphic information content (PIC), marker index (MI), EMR and RP indices were calculated for all primers. With this point of view, SC15 and SC63 were the best primers to identify variability among these Fennels. Total genetic similarity based on these primers was 66 percent. The greatest genetic similarity was between Ardabil1 with Ardabil2 and Tehran2 landrace. The lowest genetic distance was between Ghazvin and Yazd fennel landrace. Cluster analysis based Jakard coefficient by UPGMA was classified all genotype to four groups and this clustering was confirmed by principal coordinate (PCo) and analysis of molecular variance (AMOVA). Portion of between group variance was just 24 percent of total variance. |
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
|
|
| نویسندگان مقاله |
فریبا نیک کردار | Fariba Nikkerdar
محسن فرشادفر | Mohsen Farshadfar
محمدعلی ابراهیمی | Muhammad Ali Ebrahimi
هومن شیروانی | Hooman Shirvani
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-312&slc_lang=fa&sid=fa |
| فایل مقاله |
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1462/article-1462-576489.pdf |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
اصلاح نباتات، بیومتری |
| نوع مقاله منتشر شده |
پژوهشی |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|