این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
مجله دانشکده پزشکی اصفهان، جلد ۴۳، شماره ۸۱۳، صفحات ۴۲۹-۴۳۷
عنوان فارسی بررسی الگوهای ساختاری در شبکه بیان ژنی بیماران وسواسی
چکیده فارسی مقاله مقاله پژوهشی مقدمه: اختلال وسواس، یک وضعیت روانپزشکی چندوجهی است که با افکار مزاحم و رفتارهای اجباری مشخص می‌شود. عوامل ژنتیکی، یکی از علل اصلی ایجاد‌کننده‌ی این اختلال می‌باشد. این مطالعه با بررسی الگوهای ساختاری در شبکه‌ی بیان ژن بیماران، از یک تحلیل شبکه هم بیان ژن وزنی جامع (WGCNA) برای روشن کردن مکانیسم‌های مولکولی زیربنایی این اختلال استفاده می‌کند. روش‌ها: این مطالعه بصورت تحلیلی بر روی داده‌های بیان ژنی در بیماران دچار اختلال وسواس در مقایسه با گروه شاهد (افراد سالم) انجام گردید. برای این منظور پس از جستجو در پایگاه‌های داد‌ه‌های بیوانفورماتیکی NCBI، Genercards، Swiss-Prot وDiseasome  ژن‌های دخیل در بیماری را که بر اساس حداقل یکی از روش‌های  in vivo، in vitro و in silico پیشنهاد شده‌اند، استخراج و به عنوان ژن‌های کاندید در نظر گرفته شد. سپس از مطالعات in vivo، in vitro و نیز in silico داده‌های بیانی جمع‌آوری گردید و شبکه‌های ارتباطی از داد‌های بیانی ژن‌های کاندید به کمک نرم‌افزار MATLAB و R رسم شد. یافته‌ها: بر اساس نتایج تحلیل شبکه ارتباطی پروتئین‌های کاندید، به کمک 5 شاخص مؤلفه‌ی بیشترین میزان همسایگی، درجه، بین، نزدیکی و شعاع به ترتیب 6 پروتئین SOX9، ACAN، RUNX2، COL1A1، COL2A1 و MMP13 بیشترین میزان تکرار و تأیید توسط این 5 شاخص را داشتند. نتیجه‌گیری: الگوهای ساختاری در شبکه‌ی بیان ژن نشان داد که ژن‌های SOX9، ACAN، RUNX2، COL1A1، COL2A1 و MMP13 در بیماران وسواسی دارای اهمیت ویژه‌ای نسبت به سایر ژن‌های کاندید هستند. این موضوع می‌تواند در تهیه و آنالیز پانل ژنتیکی تشخیصی این اختلال کمک‌کننده باشد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله بیماران وسواسی،الگوهای ساختاری،شبکه‌ی بیان ژنی،
عنوان انگلیسی Investigation of Structural Patterns in the Gene Expression Network of Patients with Obsessive-Compulsive Disorder
چکیده انگلیسی مقاله Background: Obsessive compulsive disorder is a multifaceted psychiatric condition characterized by intrusive thoughts and compulsive behaviors. Genetic factors are one of the main causes of this disorder. By examining the structural patterns in the gene expression network of patients, this study uses a comprehensive weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) to clarify the underlying molecular mechanisms of this disorder. Methods: This study was done analytically on gene expression data from obsessive-compulsive disorder patients compared to a control group (healthy people). Candidate genes involved in the disease, proposed based on at least one method (in vivo, in vitro, or in silico), were extracted from the bioinformatics databases NCBI, GeneCards, Swiss-Prot, and Diseasome. Then, expression data were collected from in vivo, in vitro and in silico studies, and communication networks were drawn from the expression data of candidate genes using MATLAB and R software. Findings: Based on the results of candidate protein communication network analysis, with the help of 5 component indicators of the highest degree of neighborhood, degree, distance, proximity and radius respectively, the 6 proteins SOX9, ACAN, RUNX2, COL1A1, COL2A1 and MMP13 had the highest frequency of being identified by these 5 metrics. Conclusion: The structural patterns in the gene expression network showed that SOX9, ACAN, RUNX2, COL1A1, COL2A1, and MMP13 genes are particularly important in obsessive-compulsive patients compared to other candidate genes. This finding could aid in the development and analysis of a diagnostic gene panel for this disorder.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله بیماران وسواسی,الگوهای ساختاری,شبکه‌ی بیان ژنی
نویسندگان مقاله معصومه رشنو |
استادیار، گروه زیست‌شناسی، واحد دزفول، دانشگاه آزاد اسلامی، دزفول، ایران.

فاطمه بساق زاده |
استادیار، گروه زیست‌شناسی، واحد دزفول، دانشگاه آزاد اسلامی، دزفول، ایران

زهرا خوشنود |
استادیار، گروه زیست‌شناسی، واحد دزفول، دانشگاه آزاد اسلامی، دزفول، ایران

نشانی اینترنتی https://jims.mui.ac.ir/article_32970_3cdbb80a0a9489dceed173cc3354ae34.pdf
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات