تحقیقات دامپزشکی، جلد ۷۱، شماره ۴، صفحات ۴۶۳-۴۷۱
عنوان فارسی تعیین هویت مولکولی و شجره شناسی بر اساس ژن نوکلئوکپسید ویروس برونشیت عفونی پرندگان جدا شده از گله های گوشتی در سالهای ۱۳۹۳-۱۳۹۴
چکیده فارسی مقاله زمینه مطالعه: برونشیت عفونی یک بیماری مهم از نظر اقتصادی در ماکیان بوده که به دلیل ظهور ژنوتیپ‌های جدید ویروس برونشیت عفونی، کنترل این بیماری بعنوان یک مشکل جدی در صنعت طیور در دنیا مطرح است و پیش از این، مطالعه جامعی برروری این ژن بر روی ژنوتیپ‌های سال‌های اخیر مختلف کشور انجام نگردیده بود. هدف: لزوم از انجام این مطالعه تعیین هویت مولکولی و شجره شناسی بر اساس ژن نوکلئوکپسید ویروس برونشیت عفونی جدا شده از گله‌های گوشتی ایران در سال‌های 1393-1394 می‌باشد. روش کار : در این بررسی ژن نوکلئو کپسید ده جدایه از چهار نوع ژنوتیپ متفاوت ویروس برونشیت عفونی با استفاده از پرایمر‌های اختصاصی تکثیر و با نرم افزار‌های مناسب شجره شناسی و تعیین ساختار مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. نتایج : از نظر شجره شناسی ویروس‌های برونشیت عفونی گروه ماساچوست، QX و 793/B در گروه خود قرار گرفتند و ژنوتیپ ویروس واریانت 2 در کنار سایر ویروس‌های جدا شده از ایران قرار داشتند. در صد تشابه بر اساس اسید آمینه، بین سویه‌های مختلف مورد مطالعه بین 97/89 تا 75/99٪ تشابه وجود داشت. بیشترین تشابه بین دو ژنوتیپ IBKG-1و IBKG-8 مورد مطالعه در گروه 793/B و کمترین تشابه بین دو ژنوتیپ QX و واریانت 2 (ویروس‌های IBKG-5 و IBKG-9) بوده، که این میزان تفاوت برای ژن نوکلئوکپسید (محافظت شده) نسبتاًً بالا می‌باشد. بررسی بیوانفورماتیک نشان داد که پروتئین در این ویروس‌ها بین 6 تا 7 صفحه بتا و بین 8 تا 10 مارپیچ آلفا دارند. نتیجه‌گیری‌نهایی: نتایج حاصل از این مطالعه می‌تواند اطلاعات مناسبی در زمینه استفاده از اطلاعات این پروتیئن در تولید پروتئین‌های نو ترکیب جهت تولید کیت‌های الایزا و روش‌های تشخیص سریع، واکسن‌های نو ترکیب و همچنین اپیدمیولوژی مولکولی این بیماری ویروسی مهم در کشور نماید.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Molecular characterization and phylogenetic study base on nucleocapsid gene of avian infectious bronchitis viruses isolated from broiler farms, 2014-2015
چکیده انگلیسی مقاله BACKGROUND: Avian infectious bronchitis (IB) is an economically important poultry disease. The emergence of new infectious bronchitis virus genotypes has complicated IB control programs. Objectives: This is the first comprehensive molecular analysis of the Nucleocapsid (N) gene of Iranian IBVs. Methods: The nucleocapsid gene of ten IBV isolates (which belonges to four different genotypes) was amplified using specific primers. The phylogenetic trees were constructed based on nucleotide and amino acid sequences of "N" gene. Results: IBV genotyping based on "N" gene showed similar IBV classification which was obtained from spike gene analysis and ten isolates  belonged to Massachusetts, QX, 793/B and Variant-2 genotypes. Different strains had 89.97- 99.75% homology in their amino acid sequences. The highest nucleotide sequence similarity was observed between IBKG-1 and IBKG-8 (793/B type IBVs), while the lowest was seen between IBKG-5 and IBKG-9 (QX- type and Variant-2 type) IBV isolates. This low similarity is of an interest because the N protein is highly conserved among different IBV strains. "N" Protein structural analysis revealed that the isolates has 8to 10 alpha helices and 6 to 8 beta sheets. Conclusions: The present study provided basic information to develop recombinant nucleocapsid proteins that are applicable in rapid diagnostic tests and ELISA and recombinant vaccines.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله وحید کریمی |
گروه بیماریهای طیور، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تهران (Tehran university)

آرش قلیان چی لنگرودی | gheilanchi langrodi
گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تهران (Tehran university)

مسعود هاشم زاده |
موسسه واکسن و سرم سازی رازی، کرج، کرج، ایران
سازمان اصلی تایید شده: موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی (Razi vaccine and serum research institute)

زینب ایمانی زاده |
گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تهران (Tehran university)

نشانی اینترنتی http://jvr.ut.ac.ir/article_60003_13047b568ce28c55b28f184f8d97394a.pdf
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/699/article-699-315024.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات