تحقیقات دامپزشکی، جلد ۷۸، شماره ۲، صفحات ۱۴۵-۱۵۶
عنوان فارسی ارزیابی تکنیک PCR-RFLP در شناسایی تنوع ژنتیکی کلستریدیوم پرفرنجنس بیوتایپA
چکیده فارسی مقاله زمینۀ مطالعه: کلستریدیوم پرفرنجنس باسیل گرم مثبت بی‌هوازی و دارای اسپور است که بیوتایپ A آن مسئول انواع بیماری‌ها از جمله التهاب روده، اسهال خونی و قانقاریای گازی و یکی از عوامل اصلی سندرم خونریزی دهنده روده گاوها می‌باشد. تنوع ژنتیکی می‌تواند بیشترین تنوع فنوتیپی، توزیع جغرافیایی، ویژگی میزبانی، بیماریزایی، مقاومت آنتی بیوتیکی و حدت را در باکتری‌ها توضیح دهد. روش مولکولی مبتنی بر الگوی باندهای D‏NA ، باکتری را بر اساس اندازه قطعات تولید شده توسط هضم آنزیمی ژنوم طبقه بندی می‌کند.هدف: استاندارد سازی و کاربرد تکنیک PCR-RFLP در شناسایی تنوع ژنتیکی جدایه‌های کلستریدیوم پرفرنجنس بیوتایپ A.روش‎کار: استخراج DNA ژنومی سویه‌ها و سنتز توالی کامل لوکوس ژنی توکسین آلفا با استفاده از پرایمرهای اختصاصی طراحی شده با تکنیک PCR انجام شد. برش آنزیمی آمپلیکون‌های سنتز شده با آنزیم محدودالاثر Mse1 انجام و قطعات حاصل با تکنیک الکتروفورز از یکدیگر تفکیک شدند و توسط نرم افزار‌های ImageJ وNTSYSPC مورد بررسی قرار گرفتند.نتایج: یافته‌های به دست آمده نشان داد که توالی لوکوس ژنی توکسین آلفا ممکن است تغییرکند و حفاظت شده نباشد. در مطالعه حاضر چهار الگوی مختلف بر مبنای برش آنزیمی شناسایی شد. جهش در این لوکوس می‌تواند منجر به ایجاد تنوع در کلستریدیوم پرفرنجنس بیوتایپ A و ایجاد سویه‌های جدید شود.نتیجه­گیری نهایی: لوکوس ژنی توکسین آلفا می‌تواند یک نشانگر مولکولی D‏NA در کلستریدیوم پرفرنجنس محسوب شود و تکنیک PCR-RFLP به عنوان ابزاری برای تایپینگ این باکتری و تخمین میزان روابط فیلوژنتیکی از طریق مطالعات مقایسه‌ای توالی‌های نوکلئوتیدی کاربرد داشته باشد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله تایپینگ،توکسین آلفا،ژنوم،سندرم خونریزی‌دهنده روده،کلستریدیوم پرفرنجنس،
عنوان انگلیسی Evaluating PCR-RFLP Technique in Identifying Genetic Diversity Clostridium perfringens Biotype A
چکیده انگلیسی مقاله BACKGROUND: Clostridium perfringens (C. perfringens) is an anaerobic Gram-positive bacillus with spores, whose biotype A is responsible for a variety of diseases, including intestinal inflammation, bloody diarrhea, and gas gangrene, and hemorrhagic bowel syndrome. Genetic variety can explain the bacteria’s phenotypic diversity, geographic distribution, host specificity, pathogenicity, antibiotic resistance, and virulence. A molecular method using the pattern of DNA bands classifies bacteria based on the size of fragments produced by enzymatic digestion of the genome.OBJECTIVES: This study aims to standardize the polymerase chain reaction (PCR)- restriction fragment length polymorphism (RFLP) method in identifying the genetic diversity of C. perfringens biotype A isolates.METHODS: The genomic DNA of the investigated strains was extracted, and the complete sequence of the alpha toxin gene locus was synthesized using specific primers designed by PCR technique. Enzymatic cleavage of the synthesized amplicons was performed with the Mse l restriction enzyme, and the resulting fragments were separated by electrophoresis and analyzed by ImageJ and NTSYSPC software.RESULTS: The findings showed that the alpha toxin gene locus sequence may change and is not conserved. In this research, 4 different patterns were identified based on enzymatic cleavage. Mutations in this locus can lead to diversity in C. perfringens biotype A and the creation of new strains.CONCLUSIONS: The results of this research showed that the alpha toxin gene locus could be considered a DNA molecular marker in C. perfringens, and the PCR-RFLP technique can be used as a tool for typing this bacterium and estimating the phylogenetic relationships through comparative studies of nucleotide sequences.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله تایپینگ,توکسین آلفا,ژنوم,سندرم خونریزی‌دهنده روده,کلستریدیوم پرفرنجنس
نویسندگان مقاله حمید موسی حسنخانی |
دانش آموخته واحد کرمان، دانشگاه آزاد اسلامی، کرمان، ایران

مهرداد َشمس الدینی بافتی |
بخش تحقیق و تولید فرآورده‎های بیولوژیک، شعبه کرمان، موسسه تحقیقات واکسن و سرم‌سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرمان، ایران

نادیا کاظمی پور |
گروه میکروبیولوژی، واحد کرمان، دانشگاه آزاد اسلامی، کرمان، ایران

مجتبی علی ملایی |
بخش تحقیق و توسعه، شعبه کرمان، موسسه تحقیقات واکسن و سرم‌سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرمان، ایران

فرخ رخ بخش زمین |
گروه میکروبیولوژی، واحد کرمان، دانشگاه آزاد اسلامی، کرمان، ایران

نشانی اینترنتی https://jvr.ut.ac.ir/article_93482_2c89ea036f0f107409741820918e2961.pdf
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات