پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، جلد ۱، شماره ۲، صفحات ۴۳-۵۴
عنوان فارسی غربالگری لاین‌های آلوپلاسمیک برنج (Oryza sativa L.) با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD
چکیده فارسی مقاله در سیستم سه لاینی تولید بذر هیبرید برنج، بخش اعظمی از ناخالصی ژنتیکی در مرحله تکثیر و نگهداری لاین‌های نر عقیم سیتوپلاسمی (CMS) صورت می‌گیرد، در نتیجه بذور لاین‌های CMS با بذور لاین‌های نگهدارنده (B) اختلاط می‌یابند. در این راستا انگشت‌نگاری لاین‌های اصلاحی و شناسایی نشانگرهای اختصاصی، پیش زمینه آزمون خلوص ژنتیکی این لاین‌ها است. بدین منظور شش لاین نر عقیم سیتوپلاسمی شامل ندا A، نعمت A، دشت A، چمپا A، آمل3 A و IR58025A به همراه شش لاین نگهدارنده باروری با استفاده از 25 آغازگر RAPD مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. به دلیل زمینه ژنتیکـی مشابه لاین‌های CMS و نگهدارنده، لاین‌های ایزوژن در اکثر مکان‌های نشانگری از الگوی باندی یکسانی برخوردار بودند. در این پژوهش تنها در مورد آغازگرهای OPH20 و OPH01 به ترتیب قطعه 950 و 850 نوکلئوتیدی شناسایی گردیدند که قادر به تمایز لاین‌های CMS و لاین‌های B از یکدیگر می‌باشند یعنی لاین‌های C‏MS دارای باندهای اختصاصی بوده، در حالی که لاین‌های نگهدارنده فاقد قطعه مذبور می‌باشند. جهت بررسی ماهیت هسته‌ای یا سیتوپلاسمی بودن این باندها، قطعه OPH20-950 bp از لاین‌های ندا A و IR58025A جداسازی و با استفاده از سیستم T/A در باکتری Escherichia coli سویه DH5 همسانه‌سازی و نهایتاً تعیین ترادف گردیدند. آنالیزهای همردیفی قطعه مورد نظر با توالی موجود در بانک ژن، نشان‌دهنده همولوژی 95 درصدی با توالی ژنوم میتوکندریایی بود. تحقیقا از نتایج این مطالعه می‌توان در شناسایی و بررسی خلوص ژنتیکی لاین‌های CMS (نوع WA) استفاده نمود.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Screening of Rice (Oryza sativa L.) Alloplasmic Lines Via RAPD Molecular Markers
چکیده انگلیسی مقاله In three-line system, cytoplasmic male sterile (CMS) lines often were contaminated with cognate iso-nuclear maintainer lines during seeds multiplication processes. Therefore fingerprinting of breeding lines and identification of line-specific markers are prerequisite in genetic purity test. Six CMS lines including Neda-A, Nemat-A, Dasht-A, Amol 3-A, Champa-A, IR58025A and their iso-nuclear maintainers were used in this study. Twenty-five random amplified polymorphic DNA (RAPD) primers used for screening CMS lines and maintainer lines. The result indicated that the iso-gene lines had similar band patterns in most marker loci due to similar genetic background that present between CMS lines and co-maintainer lines. However two specific bands, 950 bp and 850 bp were produced by OPH20 and OPH01 primers that could uniquely recognize the CMS lines from their cognate maintainer lines, respectively. The genetic nature of OPH20-950 band was determinated by isolation of fragment from gel, clone to Escherichia coli bacteria via T/A cloning system, and was sequenced. A BLAST search of OPH20-950 sequence with GenBank indicated 95% homology to a rice mitochondrial DNA. These line-specific fragments could be used as a specific feature (scare marker) for characterization and genetic purity test of WA CMS lines.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله سیدحمیدرضا هاشمی | seyed hamidreza


قربانعلی نعمت زاده |


سید محمد علوی | seyed mohammad


مرتضی اولادی |


نشانی اینترنتی http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-57&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1462/article-1462-249285.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده اصلاح نباتات
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات