پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، جلد ۸، شماره ۱۷، صفحات ۲۳-۱۷
عنوان فارسی گروه بندی و بررسی الگوی بیان ژن های خانواده bZIP در ریشه گیاه گوجه فرنگی تحت تنش دمای پایین
چکیده فارسی مقاله bZIP یکی از مهم­ترین عوامل رونویسی هستند که در اکثر تنش­ها فعال هستند و باعث بیان و تنظیم تعدادی زیادی ژن در طی تنش­های محیطی می­شوند. گیاه گوجه فرنگی دارای 73 ژن bZIP است که تاکنون این ژن­ها گروه­بندی نشده­اند. در این تحقیق با استفاده از مطالعه نواحی فعالیت و اتصال به DNA، این خانواده بزرگ از عوامل رونویسی گروه­بندی گردید. نتایج گروه­بندی نشان داد که bZIPs گوجه­فرنگی طبق عملکرد و میزان همولوژی با ژن­های bZIP آرابیدوپسیس در یازده گروه قرار می­گیرند. سه ژن Solyc06g074320، Solyc01g109880 و Solyc10g085210 به ترتیب از گروه­های D، I و B برای مطالعه بیان ژن تحت تنش دمای پایین انتخاب شدند. دو ژنوتیپ حساس به سرما (Moneymaker) و مقاوم به سرما (LA1777) گیاه گوجه فرنگی در مرحله گیاهچه­ای تحت شرایط دمای نرمال (23 درجه سانتی­گراد) و دمای پایین (15 درجه سانتی­گراد) برای مطالعه بیان ژن در ریشه کشت گردیدند. نتایج نشان داد که ژن Solyc06g074320 کمتر از Solyc01g109880 و Solyc10g085210 تحت تنش دمای پایین در ریشه گیاه گوجه­فرنگی القاء می­شود. نتایج این بررسی می­تواند نقطه شروعی برای مطالعه عملکردی ژن­های خانواده bZIP در آینده باشد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Classification and Gene Expression Analysis of bZIP Family in Tomato Root under Sub-Optimal Temperature
چکیده انگلیسی مقاله Transcription factors (TFs) are master regulators that control gene clusters Plant bZIP (basic region/leucine zipper) transcription factors play crucial roles in biological processes. The Tomato genome sequence contains 73 genes of bZIP transcription factors. The bZIPs in tomato have never been classified. In this study, 73 genes of bZIP transcription factors were classified in 11 groups by their DNA-binding domains, conserved motifs and phylogeny results. Some bZIP proteins were not classified into any group. The cold-sensitive tomato cultivar (S. lycopersicon cv. Moneymaker) and cold-tolerant of the wild tomato species (S. habrochaites, LA1777) were compared for analyzing gene expression of three slbZIP genes (Solyc06g074320, Solyc01g109880 and Solyc10g085210) in root under sub-optimal temperature (15⁰C) and normal temperature (23⁰C). Our results show that Solyc06g074320gene was induced less than Solyc01g109880 and Solyc10g085210 genes under sub-optimal temperature in tomato root. The results of this work will be for understanding bZIP relationships and important starting point for functional analysis.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله پرویز حیدری |


حمید نجفی زرینی | najafi zarrini


نشانی اینترنتی http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-152&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1462/article-1462-249127.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده اصلاح نباتات
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات