این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
پنجشنبه 1 آبان 1404
مجله دانشگاه علوم پزشکی فسا
، جلد ۱۰، شماره ۳، صفحات ۲۴۲۹-۲۴۳۸
عنوان فارسی
پیشگویی اپی توپ های پیوسته زنجیره های سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط ایمونوانفورماتیک (مقاله انگلیسی)
چکیده فارسی مقاله
زمینه و هدف: ایمونوگلوبولینها که نقش حیاتی در دفاع علیه میکروارگانیسم ها دارند, از زنجیره های سبک و سنگین تشکیل شده اند. زنجیره های سبک به دو ایزوتیپ کاپا و لامبدا تقسیم می شوند. تغییرات قابل توجهی در نسبت زنجیره های کاپا به لامبدا در برخی بدخیمی های لنفوسیتهای B روی میدهد. آنتی بادیهای منوکلونال ضد زنجیره های سبک, در تشخیص و ایمونوتراپی ناهنجاری های پرولیفراتیو سلولهای B کاربرد دارند. هدف مطالعه حاضر تعیین اپی توپهای پیوسته زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط ایمونوانفورماتیک میباشد. مواد و روش ها: توالی اسیدهای امینه و ساختار سوم زنجیره سبک ایمونوگلوبولینIgG) G) مرجع انسان در پایگاه اطلاعاتی PDB، ساختار دوم IgG توسط نرم افزار Phyre2 و اپی توپهای پیوسته زنجیره های سبک توسط نرم افزار های Bepipred و Ellipro تعیین شدند. نتایج: چهار اپی توپ پیوسته در دومین ثابت زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط نرم افزار Bepipred شناسایی شدند . این اپی توپها درناحیه قرارگیری اسیدهای آمینه شماره 110-130, 150-,160 160-175 و180-205 واقع شده اند. شاخص ترین اپی توپ در موقعیت اسیدهای آمینه 160-175 قرار گرفته است. همچنین یک اپی توپ پیوسته در ناحیه اسیدهای آمینه 198- 203 توسط نرم افزار Ellipro شناسایی شد. نتیجه گیری: در این پژوهش تعدادی از اپی توپهای پیوسته دومین ثابت زنجیره سبک ایمونوگلوبولین شناسایی شدند. این اپی توپها ابزارهای بسیار ارزشمندی جهت تولید آنتی بادیهای مونوکلونال شناسایی کننده اختصاصی زنجیره سبک ایمونوگلوبولین بوده و میتوانند برای تولید کیتهای تشخیصی اختصاصی زنجیره سبک، کنترل بیماریهای مونوکلونال زنجیرههای سبک, درمان برخی بدخیمی های لنفوسیت B و تعیین نقشه اپی توپهای زنجیره سبک مفید باشند.
کلیدواژههای فارسی مقاله
اپی توپ پیوسته، ایمونوگلوبولین ، زنجیره سبک، ایمونوانفورماتیک
عنوان انگلیسی
In Silico Prediction of Continuous Epitopes on Human immunoglobulin Light Chains
چکیده انگلیسی مقاله
Background & Objective: Immunoglobulins (Igs) have a vital role in body protection against germs. Igs contain heavy and light chains. Ig light chains consist of two isotypes: Kappa and lambda. Remarkable alterations in kappa to lambda proportion could occur in monoclonal growth of malignant B cells. Anti-human light chain monoclonal antibodies (MAbs) have medical implication in diagnosis and immunotherapy of B-cell proliferative disorders. In current study, prediction of continuous epitopes in constant part of human Ig light chain by immunoinformatics is explained. Materials & Methods: Amino acid sequence and third structure of reference human IgG light chain was obtained in PDB database. Second IgG structure was identified by Phyre 2 software. Continuous epitopes of Ig light chains were delineated by Bepipred and Ellipro software programs. Results: Four continuous epitopes situated to constant domain of human Ig light chain were predicted by Bepipred software. These continuous epitopes were located at amino acid sequences 110-130, 150-160, 160-175 and 180-205 of Ig light chain. The prominent epitope was sited at amino acids 160-175. Also, one continuous epitope situated in 198-203 amino acid sequences was predicted by Ellipro software. Conclusion: In present study several continuous epitopes sited to constant part of human Ig light chain were determined. These epitopes are valuable for making specific monoclonal anti- Ig light chain antibodies and could have plausible implication in generation of specific diagnostic kits for human Ig light chain, monitoring the monoclonal light chain diseases, treatment of associated B cell malignancies and epitope mapping of Ig light chain.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
Continuous epitope, Immunoglobulins, Light chains, Immunoinformatics
نویسندگان مقاله
سهیلا روهانی | Soheyla Rohani
Department of Immunology, Faculty of Medicine, Shahed University, Tehran, Iran
گروه ایمونولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه شاهد، تهران، ایران
فاطمه حاجی قاسمی | Fatemeh Hajighasemi
Department of Immunology, Faculty of Medicine, Shahed University, Tehran, Iran
گروه ایمونولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه شاهد، تهران، ایران
نشانی اینترنتی
http://jabs.fums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2628-1&slc_lang=en&sid=1
فایل مقاله
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
en
موضوعات مقاله منتشر شده
ایمونولوژی
نوع مقاله منتشر شده
پژوهشی
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات