این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
ژنتیک نوین، جلد ۱۱، شماره ۱، صفحات ۱۰۱-۱۰۹
عنوان فارسی هم‌ردیف‌سازی چندگانه و رسم درخت فیلوژنتیک به روش Neighbor-joining ژن cp ویروس موزاییک کاهو در استان گلستان
چکیده فارسی مقاله اخیراً علائم بیماری ویروسی موزاییک کاهو (Lettuce mosaic virus, LMV) در سطح وسیعی از مزارع کاهو استان گلستان شایع شده‌است. این ویروس از بیمارگرهای مخرب و مهم اقتصادی است که متعلق به جنسPotyvirus و خانواده Potyviridaeمی‌باشد. طی سال زراعی 93-1392 به‌منظور ردیابی ویروس LMV، 93 نمونه که دارای علائم موزاییک، پیسک، کوتولگی و عدم تولید تاج طبیعی بودند از مزارع کاهو استان گلستان جمع‌آوری شده و آلودگی ویروسی در نمونه‌ها به وسیله آزمون DAS-ELISA و آنتی‌سرم منوکلونال LMV بررسی شد. نتایج آزمون سرولوژیکی نشان داد که 80 نمونه از نظر آلودگی به ویروس مثبت بودند، در حالی‌که علائم زردی منفی بود. از نمونه‌های آلوده، تعدادی از آن‌ها به منظور ردیابی ویروس تعیین ترادف شدند.RNA کل از نمونه‌های مذکور استخراج شد و در آزمون RT-PCR با استفاده از آغازگر عمومی پوتی‌ویروس، قطعه 327 جفت بازی تکثیر شد که مربوط به ژن Cp می‌باشد. توالی‌های بدست آمده، با توالی‌های موجود در GenBank، مقایسه شدند. هم‌ردیف‌سازی‌های چندگانه و آنالیزهای تبارزایی با نرم‌افزارهای DNASTAR، DNAMAN، Clustal X انجام و درخت فیلوژنتیک به روش Neighbor-joining ترسیم شد. نتیجه ترادف توالی نشان داد که نمونه‌های استان گلستان به LMV آلوده می‌باشند و آنالیزهای تبارزایی تعیین کرد که جدایه گلستان شباهت 7/99 درصدی در سطح نوکلئوتیدی با جدایه فرانسه (Z78229) داشت. این اولین گزارش از آلودگیLMV و تعیین توالی Cp ژنوم این ویروس در استان گلستان می‌باشد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله ویروس موزاییک کاهو (LMV)،آزمون سرولوژیکی DAS-ELISA، RT-PCR،تجزیه تبارزایی
عنوان انگلیسی Multiple alignment and phylogenetic tree drawn by the neighbor-joinin cp gene of Lettuce mosaic virus in Golestan province
چکیده انگلیسی مقاله lately the symptoms of this viral diseases Lettuce mosaic virus (LMV) have become prevalent in lettuce farms. This virus destructive and economically important disease which is belonging to the genus potyvirus of potyviridae. In order to detect these viruses plants were visited, and 93 samples with mosaic, mottle, stunting and absence of natural crown symptoms were collected in 2013- 2014 from lettuce fields around Gorgan and transferred to the lab in plastic bags and beside the ice. samples were examined using DAS-ELISA serological test by LMV-IgG monoclonal antibodies. 80 samples with symptoms of mosaic, and mottle showed positive reactions to the ELISA test and yellowing symptoms had negative results. Some of the infected samples were chosen for sequencing. Total RNA of the samples was extracted to confirm the virus infection after cDNA syntheses, to amplify a partial fragment of protein coat gene (CP) by reverse transcription polymerase chain (RT-PCR) using potyvirus universal primers (Oligo1n/Oligo2n). The sequence were compared by different countries in Gen Bank. Multiple alignment and phylogenetic analysis performed by DNASTAR, DNAMAN, ClustalX programs and the neighbor-joinin method was drawn for phylogenetic tree. Sequencing results revealed the samples were infected by LMV. Phylogenetic analysis of iranian isolate (Golestan) showed 99.7% similarity at the nucleotide level with french isolate ) Z78229). this is the first report of sequencing of LMV virus protein coat from lectuce fields in Golestan province of Iran.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله سپیده علیجانی | سپیده علیجانی


سعید نصرالله نژاد | سعید نصرالله نژاد


مجید جعفری | مجید جعفری


فاطمه زینتی فخرآباد | فاطمه زینتی فخرآباد


نشانی اینترنتی http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-109-408&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1516/article-1516-1988775.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات