این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
جمعه 21 شهریور 1404
ژنتیک نوین
، جلد ۱۱، شماره ۴، صفحات ۵۵۹-۵۶۸
عنوان فارسی
بررسی تنوع ژنتیکی ارقام انگور با استفاده از نشانگرهای رتروترنسپوزونی IRAP و REMAP
چکیده فارسی مقاله
تعیین تنوع ژنتیکی مواد گیاهی، گام اولیه برای شناسایی، حفظ و نگهداری ذخایر توارثی بوده و اهمیت زیادی در اجرای برنامههای اصلاحی دارد. بهمنظور بررسی تنوع ژنتیکی 25 رقم انگور شهرستانهای شاهرود و سیسخت از 9 آغازگر و ترکیب آغازگری رتروترنسپوزونی شامل سه آغازگر IRAP و شش ترکیب آغازگری REMAP استفاده شد. در مجموع 87 باند تولید شد که 79 باند در بین ارقام چندشکل بودند. تعداد باندهای چندشکل از چهار (Tvv1Fa+Ms11) تا 12 باند (Vin1Fa) به ازای هر آغازگر متغیر بود. هتروزیگوسیتی موردانتظار از 29/0 (Tvv1Fa+ Ms8) تا 44/0 (Vine1Fa+ Ms3) متغیر و میانگین آن 35/0 بهدست آمد. میانگین درصد چندشکلی در بین ارقام مورد مطالعه 83/95 درصد بود. تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) نشان داد که پنج مولفه اول توانستند در مجموع، 5/68 درصد از واریانس کل را توجیه کنند. تجزیه کلاستر به روش UPGMA براساس ضریب تشابه جاکارد با ضریب همبستگی کوفنتیک 89/0، ارقام مورد مطالعه را در شش گروه متفاوت قرار داد بهطوریکه در گروه اول تا ششم بهترتیب 13، 4، 2، 3،2 و 1 رقم از ارقام مورد مطالعه قرار گرفتند. بر اساس این گروهبندی سه رقم سیاهدانه بلند، سیاه دانه گرد و عسکری که از شهر سیسخت انتخاب شدند در سه گروه مجزا قرار گرفتند که نشاندهنده تفاوت ژنتیکی این ارقام میباشد. نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که نشانگرهای IRAP و REMAP توسعهیافته بر اساس رتروترنسپوزونهای فعال در ژنوم انگور میتوانند بهعنوان نشانگرهای ملکولی کارا در تسریع برنامه-های اصلاحی در انگور مورد استفاده قرار گیرند.
کلیدواژههای فارسی مقاله
انگور،تنوع ژنتیکی،رتروترنسپوزون،IRAP،REMAP
عنوان انگلیسی
Assessment of genetic diversity in Grapevine cultivars using IRAP and REMAP retrotransposon-based markers
چکیده انگلیسی مقاله
Determination of genetic diversity in plant material is the initial step to identify and preservation of genetic resources and also is important in conducting of breeding programs. In order to study genetic variation among 25 grapevine cultivars of Shahrood and Sisakht regions, nine retrotransposonal primer combinations including 3 IRAP primers and 6 REMAP primers combination were used. Totally, 87 bands produced that 79 bands were polymorphic among cultivars. Numbers of polymorphic bands varied from 4 (Tvv1Fa+Ms11) to 12 (Vin1Fa) bands per primer. Expected heterozygosis ranged from 0.29 (Tvv1Fa+ Ms8) to 0.45 (Vine1Fa+ Ms3) with an average of 0.35. Average of polymorphism percentage among evaluated cultivars was 95.83%. Principle coordinates analysis (PCoA) showed that first five components explained 68.5% of total variance. Cluster analysis using UPGMA method based on Jaccard similarity coefficient with cophenetic correlation coefficient of 0.89, divided grapevine cultivars into 6 different groups. In the first to sixth group, 13, 4, 2, 3, 2 and 1 cultivars were assigned respectively. According to this grouping, cultivars named Syah-Daneh Boland, Syah-Daneh Gerd and Asgari from SySakht city were assigned in three different groups that showed genetic differences among these cultivars. The results of this study indicated that IRAP and REMAP markers developed based on active retrotransposons in the grapevine genome can be used as efficient molecular markers to accelerate grapevine breeding programs.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
grapevine, Genetic variation, polymorphism, ,IRAP ,REMAP
نویسندگان مقاله
محمدقاسم کشاورزخوب | محمدقاسم کشاورزخوب
شاهرخ قرنجیک | شاهرخ قرنجیک
اسد معصومی اصل | اسد معصومی اصل
مهدیه پارسائیان | مهدیه پارسائیان
بابک عبدالهی مندولکانی | بابک عبدالهی مندولکانی
نشانی اینترنتی
http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-109-454&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1516/article-1516-1988725.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات