این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
ژنتیک نوین، جلد ۱۲، شماره ۳، صفحات ۴۸۳-۴۸۸
عنوان فارسی ردیابی و بررسی مولکولی دو جدایه جدید ویروس موزائیک ایرانی قیاق (IJMV) در مزارع ذرت استان مازندران
چکیده فارسی مقاله پوتی‌ویروس‌ها متعلق به خانواده Potyviridae یکی از بزرگ‌ترین گروه‌های ویروس‌های گیاهی با بیش‌ترین اهمیت اقتصادی بوده و عامل 40 درصد بیماری‌های ویروسی در گیاهان مختلف می‌باشند. ویروس موزائیک ایرانی قیاق (IJMV) از پوتی‌ویروس‌های مهم غلات می‌باشد و یکی از عوامل مهم موزائیک ذرت در ایران به‌شمار می‌رود. به‌منظور بررسی این ویروس، طی سال‌های 1393-1392 تعداد 90 نمونه دارای علائم ویروسی از مزارع ذرت استان مازندران جمع‌آوری و با آزمون الایزای غیر مستقیم توسط آنتی‌سرم اختصاصی ویروس مذکور مورد بررسی قرار گرفت. RNA ویروس از نمونه‌های الایزا- مثبت استخراج شد، و در آزمون RT-PCR با استفاده از آغازگرهای دژنره مربوط به ناحیه ژنومی cylindrical inclusion (CI) اعضای جنس پوتی‌ویروس، قطعه‌ای به‌طول 680 جفت‌باز تکثیر شد. به‌منظور بررسی‌های تکمیلی، محصول PCR دو جدایه از شهرستان بابلسر پس از همسانه‌سازی در حامل پلاسمیدی pTG19-T ، توالی‌یابی شدند. نتایج داده‌های ترادف نوکلئوتیدی در BLASTn وجود IJMV را تایید نمود. با مقایسه و تجزیه توالی به‌دست آمده با جدایه‌های موجود در بانک ژن، مشخص شد که دو جدایه تعیین توالی شده بیش‌ترین شباهت را در سطح نوکلئوتیدی (2/84 درصد) و آمینو‌اسیدی (8/97 و 3/97 درصد) با جدایه شیراز (با شماره دسترسی JQ692088) که میزبان آن قیاق می‌باشد، دارند. اختلاف نوکلئوتیدی زیاد جدایه‌های به‌دست آمده از ذرت در مقایسه با جدایه به‌دست آمده از قیاق نشان-دهنده تنوع ژنتیکی بالای این ویروس است. نتایج این تحقیق، وقوع و گسترش IJMV در استان مازندران را با روش‌های سرولوژیکی، مولکولی و توالی‌یابی بخشی از ژن CI اثبات می‌کند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله آنالیز فیلوژنتیکی،الایزا،ژن CI،IJMV،RT-PCR
عنوان انگلیسی Detection and Molecular Characterization of Two New Isolates of Iranian johnsongrass mosaic virus in Corn Fields of Mazandaran Province
چکیده انگلیسی مقاله The genus Potyvirus is one of the largest and economically important groups of plant viruses, due to their effects on crops worldwide. Potyviruses are accounted for 40% of viral diseases of various plants. Iranian johnsongrass mosaic virus (IJMV) is one of the important potyviruses infecting cereal crops and one of the main causal agents of maize mosaic in Iran. In order to study the this virus, 90 samples showing virus-like symptoms were collected from different maize fields in Mazandaran province during 2013-2014 and evaluated with DAS-ELISA test using polyclonal specific antibody. RT-PCR assay with degenerate primers corresponding to the virus CI gene led to the amplification of the expected DNA fragment with a length of 680 bp in all ELISA-positive samples. Two fragments were cloned in a pTG19-T vector and sequenced. BLAST analysis of the sequenced data confirmed that the PCR-amplified fragments belonged to IJMV. Phylogenetic analysis based on partial sequences of CI gene showed that these two isolates of IJMV had the highest nucleotide (84.2%) and amino acid (97.3%, 97.8%) identities and a close phylogenetic relationship with another Iranian isolate of IJMV namely Shz (JQ692088) isolated from Johnsongrass and previously reported from Shiraz. High-nucleotide differences between the IJMV isolates obtained from maize and Shz isolate from johnsongrass indicating high nucleotide variability of this potyvirus. These results demonstrated the occurrence and spread of IJMV in the maize fields of Mazandaran province based on serological test, RT-PCR, and CI gene analyses.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله IJMV, ,ELISA, ,RT-PCR, ,CI gene, ,Phylogenetic analysis
نویسندگان مقاله زهره مرادی | زهره مرادی


احسان نظیفی | احسان نظیفی


محسن مهرور | محسن مهرور


نشانی اینترنتی http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-109-509&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1516/article-1516-1988684.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات