علوم زراعی ایران، جلد ۱۲، شماره ۳، صفحات ۳۳۳-۳۴۸
عنوان فارسی ارزیابی تنوع ژنتیکی در نمونه‌های دو گونه جو (L. H. vulgare و.H. spontaneum L. ) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
چکیده فارسی مقاله در این آزمایش تنوع ژنتیکی 73 نمونه جو ایران از دو گونه H. vulgare و H. spontaneum با استفاده از 15 جفت نشانگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. الگو های نواری بصورت صفر (عدم وجود باند) و یک (وجود باند) امتیاز دهی شدند. برای رسم دندروگرام ابتدا ماتریس تشابه با روش دایس تشکیل و سپس دندروگرام با استفاده از الگوریتم UPGMA با نرم افزار NTSYSpc 2.0 رسم شد. همچنین از این نرم افزار برای رسم پراکنش نمونه‌ها در دو بعد اول تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) نیز استفاده شد. بیشترین تعداد آلل در گونه H. vulgare مربوط به جایگاه‌های Bmac0316 و Hvm40 با 8 آلل و کمترین آن مربوط به جایگاه Hvm70 با دو شکل بود. بیشترین تعداد آلل در گونهH. spontaneum مربوط به جایگاه Hvm40 (با 9 آلل) و کمترین آن مربوط به جایگاه‌های Hvm70 و HvmLoH1A (با 2 آلل) بود. میزان PIC درگونه H. vulgare از80/0 (جایگاه Bmac0040) تا 19/0 (جایگاه Bmag0603) و در گونه H. spontaneum از 91/0 (جایگاه Bmac0415) تا 043/0 (جایگاه Hvm70) متغیر بود. تجزیه خوشه‌ای با استفاده از ضریب دایس و الگوریتم UPGMA نمونه‌ها را به سه گروه تقسیم کرد. گروه اول شامل نمونه‌هایی از هر دو گونه H. spontaneum و H. vulgare که از ایران جمع آوری شده‌اند و گروه‌های دوم و سوم نیز به ترتیب شامل نمونه‌هایی از گونه‌های H. spontaneum و H. vulgare بود. نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی با نتایج حاصل از تجزیه خوشه‌ای همخوانی داشت. نتایج این تحقیق نشان داد که نشانگرهای ریزماهواره برای بررسی تنوع در هر دو گونهH. spontaneum و H. vulgare مفید می‌باشند. جایگاه‌های HvmLoH1A و Ebmac0415 در گونه H. spontaneum و جایگاه‌های Bmac0306 و Bamc0040 در گونه H. vulgare برای بررسی تنوع در این گونه‌ها مناسب تشخیص داده شدند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Assessment of genetic diversity in accessions of two barely species (H. vulgare L. and H. spontaneum L.) using SSR markers
چکیده انگلیسی مقاله Genetic diversity of 73 accessions of two barely species (H. vulgare L. and H. spontaneum L.) was evaluated using 15 SSR pair primers. Patterns were scored by 0 (band abscence) and 1 (band presence). Dendrogeram was constructed using dice similarity coefficient and UPGMA algorithm by software NTYSYS 2.02. Principle coordinate analysis was also performed. The highest number of polymorphic alleles in H. vulgare L. accessions were observed in gene loci Bmac 0316 and Hvm40 with eight alleles in each. The lowest number of polymorphic alleles in H. vulgare L. accessions were observed in gene locus Hvm70 with two alleles. Moreover, the highest number of polymorphic alleles in H. spontaneum L. were observed in Hvm40 locus with 9 allels, while the lowest obtained in Hvm70 and HvmloH1A with two alleles, respectively. The highest PIC value in H. vulgare L. was 0.8 (gene loci Bmac0040) and the lowest 0.19 (gene loci Bmag0603). While, the highest and the lowest value of PIC in H. spontaneum L. ranged from 0.43-0.91. Cluster analysis using Dice similarity method and UPGMA algorithm, grouped all accessions in three main groups. Group one included populations from both of H. vulgare L. and H. spontaneum L. species collected from Iran, while groups two and three included accessions of H. spontaneum L. and H. vulgare L., respectively. Results showed that SSR markers can be apllied as reliable tool to evaluate genetic diversity between and within H. vulgare L. and H. spontaneum L. species. Loci HvmLoH1A and Ebmac0415 in H. spontaneum L. and loci Bmac0306 and Bamc0040 in H. vulgare L. can be used to estimate genetic diversity in these two barely species.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله امین ابراهیمی |
پردیس کشاورزی و منابع طبیعی د انشگاه تهران

محمدرضا نقوی | mohammad reza
پردیس کشاورزی و منابع طبیعی د انشگاه تهران

منی ژه سبکدست |
پردیس کشاورزی و منابع طبیعی د انشگاه تهران

محسن مردی |
پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی، کرج
سازمان اصلی تایید شده: پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران

نشانی اینترنتی http://agrobreedjournal.ir/browse.php?a_code=A-10-1-154&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/959/article-959-195510.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده تخصصی
نوع مقاله منتشر شده علمی - پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات