این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
سه شنبه 6 آبان 1404
پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی
، جلد ۱۱، شماره ۲۹، صفحات ۰-۰
عنوان فارسی
بررسی تنوع مولکولی نواحی فاصله انداز رونویسی شونده داخلی (ITS۱,۴) در برخی ژنوتیپ های کاهو
چکیده فارسی مقاله
کاهو از خانواده کاسنیان، برگی، سرمادوست یکساله، غنی از مواد معدنی، ویتامینها و مواد مغذی است. هدف تحقیق حاضر ارزیابی تنوع ژنتیکی 15 رقم و جمعیت کاهو با استفاده از ناحیه ITS بود. کیفیت توالیها با استفاده از نرمافزار Chromas 2.1.1 بررسی و سپس با روش ClustalW توسط نرمافزار MegAlign 5 همردیف سازی شده و دندروگرام روابط تبار زایی و ماتریس تفاوت و تشابه توالیها ترسیم گردیدند. همچنین مقایسهای بین کاهوهای مورد استفاده در این تحقیق و سایر گیاهان جنسهای مختلف خانواده کاسنیان (ارائهشده در سایت NCBI) صورت گرفت. مقدار عددی نسبت (dNdS) برابر 015/0 بود که نشاندهنده انتخاب خالص بر ژن مورد بررسی بوده و باعث تغییرات کلیدی نشده است. تجزیه خوشهای، ژنوتیپهای مختلف کاهو را در 3 گروه تقسیم اما نتوانست بر اساس موقعیت جغرافیایی از هم تفکیک کند؛ اما توانست کاهوهای این تحقیق و سایر گیاهان جنسهای مختلف خانواده کاسنیان را از هم تفکیک کند. لذا میتوان نتیجه گرفت که ITS میتواند ابزاری مناسب جهت ارزیابیهای ژنتیکی بینگونهای و بین جنسی باشد. کمتر از یک بودن عدد dNdS و تعداد کم جایگاههای حذف و اضافه (از 1551 جایگاه، 376) نشاندهنده تغییرات کم بین لاینهای مختلف بوده لذا شاید عدم توانایی ITS در تفکیک درون گونهای جمعیتها به همین دلیل باشد. با توجه به اینکه منشأ یا خواستگاه اولیه گیاهان متعلق به مراکزی است که بیشترین تنوع را دارند و چون جمعیتهای کاهو ورزنه اصفهان دارای بیشترین تنوع بودند در نتیجه ضرورت دارد در جمعآوری ژرمپلاسمهای کاهو جهت بهرهبرداریهای اصلاح نژادی به منطقه ورزنه اصفهان توجه بیشتری شود.
کلیدواژههای فارسی مقاله
کاهو، تنوع ژنتیکی، ITS، dN/dS
عنوان انگلیسی
Study of the molecular diversity of Internal transcribed spacer region (ITS1.4) in some lettuce genotypes
چکیده انگلیسی مقاله
Lettuce is belong to the Cichorium family with leaf consumption, One-year cold weather plants and rich in minerals, vitamins and nutrients. The aim of the present study was to evaluate the genetic diversity of 15 varieties and lettuce populations using the ITS area. Sequence quality was evaluated using Chromas 2.1.1 software, aligned by MegAlign 5 software and then similarity matrix and dendrogram of phylogenic relationships of Lettuce sequences were conducted using Mega 6 software. Also, a comparison was conducted among the lettuces were used in this research and other plants of the Asteraceae genus family (presented on NCBI site). The numerical value of the ratio (dN/dS) was 0.015, which indicates a pure selection in the examined gene and has not caused any key changes. Cluster analysis split the different genotypes of lettuce into 3 groups, but could not differentiate by geographical location. But it could separate the lettuce of this research and other plants of the different species of the Asteraceae family. Therefore, it can be concluded that ITS can be a suitable tool for genetic evaluations among genus and among species. Based on this that dN/dS was less than one number and also it obtained the small number of deletion and extra positions (from 1551 positions, 376) indicating low variation between different genotypes and populations. Based on this reason it may be the inability of ITS in the interspecies differentiation of populations. Considering that the origin of the plants originates from the centers that are most diverse and because the varieties of Lettuce populations of Isfahan are the most diverse, it is therefore necessary to pay more attention to the collection of lettuce germplasms for breeding exploitation in the Varzaneh region of Isfahan.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
Lactuca sativa L, Genetic Diversity, ITS, dN/dS
نویسندگان مقاله
زهرا جمعه قاسم آبادی | zahran jomeh ghasem abadi
Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, University of Zabol
دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل
براتعلی فاخری | baratali fakheri
Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, University of Zabol
دانشگاه زابل
بهمن فاضلی نسب | bahman fazeli-nasab
Research Department of Agronomy and Plant Breeding, Agricultural Research Institute, University of Zabol, Zabol, Iran
پژوهشکده کشاورزی پژوهشگاه دانشگاه زابل، زابل
نشانی اینترنتی
http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-817-1&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1462/article-1462-1419958.doc
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
بیوتکنولوژی گیاهی
نوع مقاله منتشر شده
پژوهشی
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات