این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران، جلد ۲۶، شماره ۲، صفحات ۱۶۵-۱۷۶
عنوان فارسی جداسازی، تعیین خصوصیت و تحلیل بیان ژن ۴’OMT۲ گیاه دارویی شقایق
چکیده فارسی مقاله گیاه شقایق (Papaver somniferum L.) یکی از مهمترین گیاهان دارویی جهان بوده و چندین آلکالوئید بنزیل ایزوکوئینولینی دارویی مهم را تولید می‌کند. در این پژوهش ژن 4'OMT2 (3′-hydroxy-N-methylcoclaurine 4′-O-methyltransferase) از این گیاه جداسازی، تعیین توالی و تعیین خصوصیت شد. پس از تکثیر توالی کد‎کننده و ژنومیک ژن 4'OMT2با استفاده از PCR، این قطعات در پلاسمید pTZ57R/T همسانه‎سازی و تعیین توالی شدند. نتایج توالی‌یابی قطعاتی با طول 1074 و 1189 جفت بازی را به‎ترتیب برای توالی کد‎کننده و ژنومیک نشان داد. برای اولین بار در این گیاه، نتایج وجود یک اینترون با طول 115 جفت باز را در توالی ژنومیک ژن 4'OMT2نشان داد. ژن جداسازی شده از ژنوتیپ ایرانی با همسانی بسیار بالایی به ژن 4'OMT2جنس شقایق شباهت داشت و با همسانی بیشتر از 67 درصد به گیاهان راسته آلاله سانان شبیه بود. بررسی‌های بیوانفورماتیکی بیشتر نشان داد که ژن 4'OMT2آنزیمی پایدار را تولید می‌کند که بدون سیگنال پپتید بوده و در سیتوپلاسم تجمع پیدا می‌کند. برای بررسی آنالیز بیان ژن، پنج کتابخانه از داده‌های SRA (نوع mRNA) گیاه شقایق مربوط به ترانسکریپتوم جوانه گل، برگ، میوه در حال نمو، ساقه و ریشه از پایگاه SRA دریافت و بیان ژن جداسازی شده 4'OMT2در آنها با استفاده از نرم‎افزار IDEG6 و آزمون‌های آماری بررسی شد. نتایج نشان داد که این ژن دارای بیان متفاوتی در بافت‌های مختلف گیاه شقایق بوده و بیشترین میزان بیان را در بافت ساقه دارد. شناسایی توالی کدکننده ژن‌های بیوسنتزی و بررسی خصوصیات آنها اولین قدم در دست‎ورزی ژنتیکی و بهره‎گیری در مهندسی متابولیک است. در این پژوهش برای اولین بار توالی کد‎کننده کامل ژن 4'OMT2از گیاه شقایق جداسازی شد و وجود یک اینترون در ساختار آن مشخص و اثبات شد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله بیان ژن، O- متیل ترانسفراز، توالی ژنومیک، شقایق، SRA،
عنوان انگلیسی Isolation, characterization and expression analysis of 3-hydroxy-N-methylcoclaurine 4′–methyltransferase (4'OMT2) gene in Papaver somniferum L.
چکیده انگلیسی مقاله Poppy (Papaver somniferum L.) is one of the oldest medicinal plant in the world. It producesseveral important narcotic benzylisoquinoline alkaloids. In this study, 4'OMT2 (3′-hydroxy-Nmethylcoclaurine4′-O-methyltransferase) gene was isolated, sequenced and characterized. Afteramplification of genomic and coding sequence of 4'OMT2 gene using PCR, the fragments werecloned into pTZ57R/T plasmid and sequenced. Sequencing results showed two fragments of1074 and 1189bp for coding and genomic sequences, respectively. For the first time, resultsshowed one intron of 115bp in the genomic sequence of 4'OMT2 in the species. Isolated genefrom Iranian genotypes was similar to Papaver genus with high identity, and had 67% identityto Ranunculales plants. Further bioinformatics analyses revealed, 4'OMT2 gene produces astable enzyme without signal peptide that localize in the cytoplasm. For gene expressionanalysis, five poppy RNA-seq (mRNA type) libraries (belonging to flower bud, leaf, developingfruit, stem and root tissues) were retrieved from SRA database and analysis of 4'OMT2 geneexpression were done using IDEG6 software and statistical tests. Results showed that 4'OMT2has differential expression among different tissues and has maximum expression in stem tissues.Identification and characterization of biosynthetic genes is the first step in genetic manipulationand metabolic engineering. In present study, for the first time, full length coding sequence of4'OMT2 gene was isolated from poppy plant and presence of one intron in its sequence wasdetermined.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله سید محسن سهرابی |
دانشجوی دکتری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‌آباد

احمد اسماعیلی |
نویسنده مسئول مکاتبات، دانشیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‌آباد پست الکترونیک: ismaili.a@lu.ac.ir

فرهاد نظریان فیروزآبادی |
استاد، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‌آباد

کامران سمیعی |
دانشجوی دکتری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‌آباد

نشانی اینترنتی http://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117956_c7b76428124b6e8d0f6988b50a4e6f31.pdf
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/712/article-712-1133846.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات