این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
مجله دانشگاه علوم پزشکی فسا، جلد ۲، شماره ۳، صفحات ۲۱۸-۲۲۶
عنوان فارسی انگشت نگاری DNA بر مبنای توالی های تکرار شونده ژنومی درگونه های لاکتوباسیل های بومی ایران با استفاده از ,TGT)۵-REP-PCR)
چکیده فارسی مقاله زمینه و هدف: استفاده از لاکتوباسیل ها به عنوان پروبیوتیک ها، نیازمند به کارگیری روش های دقیق و قابل اطمینان جهت شناسایی باکتری ها در سطح سوش می باشد، زیرا بسیاری از خصوصیات پروبیوتیکی وابسته به سوش می‌باشد. انگشت نگاری DNA بر اساس توالی های تکراری ژنومی با روش REP-PCR به عنوان یک روش تایپینگ قدرتمند، جهت تعیین روابط فیلوژنیک و تاکسونومی باکتری ها مطرح می‌باشد. هدف از این مطالعه، ارزیابی و شناسایی تنوع ژنتیک سوش های لاکتوباسیل های جدا شده از منابع مختلف لبنی و غذایی سنتی در ایران می‌باشد. مواد و روش ها: ابتدا 20 سوش از محصولات لبنی سنتی از قبیل ماست، پنیر، ترخینه و دوغ ترخینه جداسازی و خالص سازی شدند. واکنش PCR جهت شناسایی ایزوله ها با استفاده از پرایمرهای دجنریت انجام گرفت و محصولات PCR پس از خالص سازی، توالی سنجی شدند. انگشت نگاری DNA با پرایمر GTG)5) جهت ژنوتایپینگ ایزوله ها انجام شد. نتایج: ایزوله های شناسایی شده تحت عنوان لاکتوباسیلوس کازئی، برویس، پلانتاروم و انتروکوکوس فاسیوم در GenBank ثبت شدند. در پروفایل REP-PCR 20 ایزوله مورد مطالعه، الگوی باندینگ متفاوتی دیده شد. روش گروه بندی UPGMA با استفاده از نرم افزار NTSYS بر روی داده های مولکولی انجام گرفت که با آنالیز PCO نیز تایید گردید. در دندروگرام حاصله سه کلاستر اصلی شکل گرفت. بحث و نتیجه گیری: روش REP-PCR یک روش کاربردی و بسیار حساس در تمایز ایزوله های مورد مطالعه می‌باشد که با نتایج حاصل از توالی یابی مطابقت کامل دارد. امید است بتوان با تهیه پروفایل های به‌ دست آمده، یک بانک اطلاعاتی دقیق تهیه نمود که جهت غربالگری اولیه و در نهایت تایپینگ باکتری های جدا شده با صرف هزینه کمتر و با سرعت بیشتر به اجرا در آید.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله لاکتوباسیلوس، تنوع ژنتیکی، انگشت نگاری GTG)5-PCR)
عنوان انگلیسی DNA Fingerprinting Based on Repetitive Sequences of Iranian Indigenous Lactobacilli Species by (GTG)5- REP-PCR
چکیده انگلیسی مقاله Background and Objective: The use of lactobacilli as probiotics requires the application of accurate and reliable methods for the detection and identification of bacteria at the strain level. Repetitive sequence-based polymerase chain reaction (rep-PCR), a DNA fingerprinting technique, has been successfully used as a powerful molecular typing method to determine taxonomic and phylogenetic relationships among bacteria. The aim of this study was to evaluate and detect the genetic diversity of lactobacilli species isolated from different sources in Iran. Material and Methods: Twenty strains were isolated from Iranian traditional yoghurt, cheese, and Tarkhineh. PCR-mediated amplification was carried out by degenerate primers. Sequencing was performed after purification of the PCR product. The rep-PCR fingerprinting by (GTG) 5 oligonucleotide primers was conducted for the discrimination and genotypic grouping of isolates. Results: Isolates were deposited as novel stains of lactobacillus casei, brevis, plantarum, and Entrococcus facium in GenBank. Clustering methods were performed on molecular data by NTSYS software, which was also supported by PCO ordination plot. The rep-PCR profiles showed that the 20 isolates produced different banding patterns. In UPGMA dendrogram, three main clusters were formed. Conclusion: According to our findings, rep-PCR appeared to be a very practical method and highly sensitive in the discrimination of the lactobacillus species. The results of sequencing corresponded to the clustering in dendrogram.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله فرزانه تفویضی | farzaneh tafvizi


مریم تاج آبادی ابراهیمی | maryam tajabadi ebrahimi


نشانی اینترنتی http://journal.fums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-66&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده ژنتیک عمومی
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات